Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IRF8Q02556 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IRF8Q02556 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IRF8Q02556 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IRF8Q02556 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
IRF8Q02556 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IRF8Q02556 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IRF8Q02556 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IRF8Q02556 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
IRF8Q02556 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRF8Q02556 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRF8Q02556 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRF8Q02556 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRF8Q02556 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRF8Q02556 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRF8Q02556 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
IRF8Q02556 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRF8Q02556 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRF8Q02556 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRF8Q02556 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRF8Q02556 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRF8Q02556 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF8Q02556 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF8Q02556 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF8Q02556 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF8Q02556 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF8Q02556 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IRF8Q02556 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IRF8Q02556 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IRF8Q02556 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IRF8Q02556 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IRF8Q02556 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IRF8Q02556 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRF8Q02556 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRF8Q02556 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRF8Q02556 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRF8Q02556 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRF8Q02556 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRF8Q02556 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRF8Q02556 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
IRF8Q02556 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRF8Q02556 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRF8Q02556 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRF8Q02556 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
IRF8Q02556 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRF8Q02556 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRF8Q02556 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRF8Q02556 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRF8Q02556 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRF8Q02556 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRF8Q02556 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRF8Q02556 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRF8Q02556 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRF8Q02556 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRF8Q02556 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRF8Q02556 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRF8Q02556 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRF8Q02556 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRF8Q02556 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRF8Q02556 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRF8Q02556 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRF8Q02556 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IRF8Q02556 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IRF8Q02556 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IRF8Q02556 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IRF8Q02556 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IRF8Q02556 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IRF8Q02556 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IRF8Q02556 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IRF8Q02556 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IRF8Q02556 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IRF8Q02556 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRF8Q02556 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRF8Q02556 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRF8Q02556 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRF8Q02556 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRF8Q02556 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRF8Q02556 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRF8Q02556 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IRF8Q02556 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IRF8Q02556 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IRF8Q02556 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IRF8Q02556 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IRF8Q02556 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IRF8Q02556 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IRF8Q02556 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IRF8Q02556 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IRF8Q02556 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IRF8Q02556 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IRF8Q02556 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
IRF8Q02556 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IRF8Q02556 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IRF8Q02556 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IRF8Q02556 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IRF8Q02556 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IRF8Q02556 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRF8Q02556 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRF8Q02556 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRF8Q02556 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRF8Q02556 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms