Protein–RNA interactions for Protein: Q02543

RPL18A, 60S ribosomal protein L18a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL18AQ02543 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL18AQ02543 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL18AQ02543 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL18AQ02543 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL18AQ02543 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL18AQ02543 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL18AQ02543 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL18AQ02543 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL18AQ02543 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL18AQ02543 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL18AQ02543 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL18AQ02543 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL18AQ02543 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL18AQ02543 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL18AQ02543 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL18AQ02543 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL18AQ02543 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL18AQ02543 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL18AQ02543 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL18AQ02543 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL18AQ02543 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL18AQ02543 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL18AQ02543 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL18AQ02543 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL18AQ02543 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL18AQ02543 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL18AQ02543 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL18AQ02543 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL18AQ02543 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL18AQ02543 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL18AQ02543 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL18AQ02543 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL18AQ02543 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL18AQ02543 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL18AQ02543 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL18AQ02543 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL18AQ02543 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL18AQ02543 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL18AQ02543 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL18AQ02543 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL18AQ02543 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL18AQ02543 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL18AQ02543 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL18AQ02543 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RPL18AQ02543 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL18AQ02543 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL18AQ02543 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL18AQ02543 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL18AQ02543 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL18AQ02543 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL18AQ02543 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL18AQ02543 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL18AQ02543 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL18AQ02543 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL18AQ02543 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL18AQ02543 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL18AQ02543 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL18AQ02543 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL18AQ02543 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL18AQ02543 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL18AQ02543 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL18AQ02543 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL18AQ02543 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL18AQ02543 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL18AQ02543 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL18AQ02543 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL18AQ02543 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL18AQ02543 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL18AQ02543 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL18AQ02543 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL18AQ02543 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL18AQ02543 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL18AQ02543 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL18AQ02543 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL18AQ02543 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL18AQ02543 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL18AQ02543 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL18AQ02543 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL18AQ02543 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL18AQ02543 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL18AQ02543 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL18AQ02543 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL18AQ02543 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL18AQ02543 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL18AQ02543 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL18AQ02543 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL18AQ02543 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL18AQ02543 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL18AQ02543 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL18AQ02543 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL18AQ02543 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPL18AQ02543 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPL18AQ02543 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPL18AQ02543 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL18AQ02543 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL18AQ02543 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL18AQ02543 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL18AQ02543 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL18AQ02543 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL18AQ02543 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms