Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTBN1Q01082 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTBN1Q01082 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTBN1Q01082 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPTBN1Q01082 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPTBN1Q01082 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPTBN1Q01082 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPTBN1Q01082 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPTBN1Q01082 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPTBN1Q01082 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SPTBN1Q01082 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPTBN1Q01082 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPTBN1Q01082 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPTBN1Q01082 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPTBN1Q01082 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPTBN1Q01082 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPTBN1Q01082 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPTBN1Q01082 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SPTBN1Q01082 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPTBN1Q01082 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPTBN1Q01082 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPTBN1Q01082 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPTBN1Q01082 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPTBN1Q01082 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPTBN1Q01082 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPTBN1Q01082 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPTBN1Q01082 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPTBN1Q01082 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTBN1Q01082 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTBN1Q01082 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTBN1Q01082 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPTBN1Q01082 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPTBN1Q01082 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPTBN1Q01082 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTBN1Q01082 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTBN1Q01082 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTBN1Q01082 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTBN1Q01082 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTBN1Q01082 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTBN1Q01082 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPTBN1Q01082 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPTBN1Q01082 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPTBN1Q01082 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPTBN1Q01082 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPTBN1Q01082 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPTBN1Q01082 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPTBN1Q01082 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPTBN1Q01082 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPTBN1Q01082 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPTBN1Q01082 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPTBN1Q01082 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTBN1Q01082 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTBN1Q01082 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTBN1Q01082 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTBN1Q01082 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPTBN1Q01082 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPTBN1Q01082 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPTBN1Q01082 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPTBN1Q01082 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPTBN1Q01082 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPTBN1Q01082 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPTBN1Q01082 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPTBN1Q01082 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTBN1Q01082 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTBN1Q01082 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTBN1Q01082 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTBN1Q01082 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTBN1Q01082 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTBN1Q01082 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTBN1Q01082 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTBN1Q01082 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTBN1Q01082 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTBN1Q01082 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTBN1Q01082 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTBN1Q01082 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPTBN1Q01082 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPTBN1Q01082 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPTBN1Q01082 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPTBN1Q01082 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPTBN1Q01082 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPTBN1Q01082 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPTBN1Q01082 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPTBN1Q01082 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPTBN1Q01082 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPTBN1Q01082 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPTBN1Q01082 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPTBN1Q01082 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPTBN1Q01082 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPTBN1Q01082 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPTBN1Q01082 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SPTBN1Q01082 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPTBN1Q01082 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPTBN1Q01082 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPTBN1Q01082 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPTBN1Q01082 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPTBN1Q01082 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPTBN1Q01082 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPTBN1Q01082 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SPTBN1Q01082 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPTBN1Q01082 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms