Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BEX3Q00994 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
BEX3Q00994 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BEX3Q00994 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BEX3Q00994 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BEX3Q00994 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BEX3Q00994 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BEX3Q00994 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BEX3Q00994 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BEX3Q00994 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BEX3Q00994 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BEX3Q00994 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BEX3Q00994 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
BEX3Q00994 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BEX3Q00994 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BEX3Q00994 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BEX3Q00994 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BEX3Q00994 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BEX3Q00994 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BEX3Q00994 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BEX3Q00994 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BEX3Q00994 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BEX3Q00994 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BEX3Q00994 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BEX3Q00994 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BEX3Q00994 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BEX3Q00994 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BEX3Q00994 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BEX3Q00994 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BEX3Q00994 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
BEX3Q00994 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BEX3Q00994 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BEX3Q00994 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BEX3Q00994 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BEX3Q00994 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
BEX3Q00994 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BEX3Q00994 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BEX3Q00994 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BEX3Q00994 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BEX3Q00994 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BEX3Q00994 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BEX3Q00994 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BEX3Q00994 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BEX3Q00994 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BEX3Q00994 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
BEX3Q00994 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BEX3Q00994 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BEX3Q00994 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BEX3Q00994 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BEX3Q00994 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
BEX3Q00994 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BEX3Q00994 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BEX3Q00994 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BEX3Q00994 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
BEX3Q00994 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BEX3Q00994 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BEX3Q00994 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
BEX3Q00994 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BEX3Q00994 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BEX3Q00994 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BEX3Q00994 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BEX3Q00994 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BEX3Q00994 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BEX3Q00994 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BEX3Q00994 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
BEX3Q00994 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BEX3Q00994 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BEX3Q00994 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BEX3Q00994 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BEX3Q00994 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
BEX3Q00994 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BEX3Q00994 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BEX3Q00994 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BEX3Q00994 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BEX3Q00994 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BEX3Q00994 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BEX3Q00994 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
BEX3Q00994 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BEX3Q00994 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BEX3Q00994 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BEX3Q00994 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BEX3Q00994 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BEX3Q00994 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BEX3Q00994 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BEX3Q00994 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
BEX3Q00994 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BEX3Q00994 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
BEX3Q00994 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BEX3Q00994 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BEX3Q00994 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BEX3Q00994 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BEX3Q00994 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BEX3Q00994 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BEX3Q00994 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BEX3Q00994 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
BEX3Q00994 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BEX3Q00994 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BEX3Q00994 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BEX3Q00994 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BEX3Q00994 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms