Protein–RNA interactions for Protein: P78411

IRX5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX5P78411 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IRX5P78411 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IRX5P78411 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IRX5P78411 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IRX5P78411 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IRX5P78411 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IRX5P78411 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IRX5P78411 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IRX5P78411 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IRX5P78411 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IRX5P78411 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
IRX5P78411 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IRX5P78411 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IRX5P78411 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
IRX5P78411 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IRX5P78411 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IRX5P78411 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IRX5P78411 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IRX5P78411 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
IRX5P78411 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
IRX5P78411 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
IRX5P78411 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
IRX5P78411 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
IRX5P78411 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
IRX5P78411 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IRX5P78411 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IRX5P78411 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IRX5P78411 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IRX5P78411 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IRX5P78411 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IRX5P78411 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IRX5P78411 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IRX5P78411 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IRX5P78411 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IRX5P78411 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IRX5P78411 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
IRX5P78411 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IRX5P78411 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IRX5P78411 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IRX5P78411 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IRX5P78411 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IRX5P78411 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
IRX5P78411 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
IRX5P78411 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IRX5P78411 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IRX5P78411 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IRX5P78411 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
IRX5P78411 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IRX5P78411 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IRX5P78411 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IRX5P78411 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IRX5P78411 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IRX5P78411 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IRX5P78411 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IRX5P78411 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IRX5P78411 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IRX5P78411 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IRX5P78411 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IRX5P78411 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IRX5P78411 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IRX5P78411 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IRX5P78411 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IRX5P78411 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
IRX5P78411 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
IRX5P78411 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IRX5P78411 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
IRX5P78411 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IRX5P78411 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IRX5P78411 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IRX5P78411 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IRX5P78411 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IRX5P78411 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
IRX5P78411 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IRX5P78411 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IRX5P78411 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IRX5P78411 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
IRX5P78411 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IRX5P78411 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IRX5P78411 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IRX5P78411 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
IRX5P78411 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
IRX5P78411 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
IRX5P78411 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IRX5P78411 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
IRX5P78411 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
IRX5P78411 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IRX5P78411 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IRX5P78411 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IRX5P78411 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IRX5P78411 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IRX5P78411 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IRX5P78411 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IRX5P78411 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IRX5P78411 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IRX5P78411 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IRX5P78411 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IRX5P78411 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IRX5P78411 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IRX5P78411 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
IRX5P78411 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms