Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERVK_113P63132 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERVK_113P63132 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERVK_113P63132 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERVK_113P63132 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERVK_113P63132 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERVK_113P63132 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERVK_113P63132 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERVK_113P63132 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERVK_113P63132 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERVK_113P63132 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERVK_113P63132 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERVK_113P63132 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERVK_113P63132 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERVK_113P63132 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERVK_113P63132 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERVK_113P63132 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HERVK_113P63132 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERVK_113P63132 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERVK_113P63132 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERVK_113P63132 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERVK_113P63132 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERVK_113P63132 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERVK_113P63132 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HERVK_113P63132 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HERVK_113P63132 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HERVK_113P63132 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HERVK_113P63132 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HERVK_113P63132 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HERVK_113P63132 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HERVK_113P63132 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HERVK_113P63132 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HERVK_113P63132 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HERVK_113P63132 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERVK_113P63132 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERVK_113P63132 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERVK_113P63132 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERVK_113P63132 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERVK_113P63132 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERVK_113P63132 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERVK_113P63132 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERVK_113P63132 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERVK_113P63132 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERVK_113P63132 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERVK_113P63132 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERVK_113P63132 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERVK_113P63132 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERVK_113P63132 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERVK_113P63132 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERVK_113P63132 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERVK_113P63132 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERVK_113P63132 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERVK_113P63132 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERVK_113P63132 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERVK_113P63132 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERVK_113P63132 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HERVK_113P63132 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERVK_113P63132 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERVK_113P63132 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERVK_113P63132 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERVK_113P63132 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERVK_113P63132 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HERVK_113P63132 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HERVK_113P63132 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HERVK_113P63132 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HERVK_113P63132 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HERVK_113P63132 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HERVK_113P63132 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERVK_113P63132 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERVK_113P63132 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERVK_113P63132 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERVK_113P63132 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERVK_113P63132 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERVK_113P63132 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERVK_113P63132 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERVK_113P63132 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
HERVK_113P63132 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERVK_113P63132 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERVK_113P63132 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERVK_113P63132 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERVK_113P63132 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HERVK_113P63132 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HERVK_113P63132 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HERVK_113P63132 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HERVK_113P63132 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HERVK_113P63132 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HERVK_113P63132 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HERVK_113P63132 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HERVK_113P63132 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HERVK_113P63132 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HERVK_113P63132 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HERVK_113P63132 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HERVK_113P63132 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HERVK_113P63132 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HERVK_113P63132 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HERVK_113P63132 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HERVK_113P63132 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HERVK_113P63132 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERVK_113P63132 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERVK_113P63132 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms