Protein–RNA interactions for Protein: P62995

TRA2B, Transformer-2 protein homolog beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2BP62995 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRA2BP62995 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRA2BP62995 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRA2BP62995 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRA2BP62995 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRA2BP62995 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRA2BP62995 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRA2BP62995 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRA2BP62995 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRA2BP62995 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRA2BP62995 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRA2BP62995 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRA2BP62995 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRA2BP62995 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRA2BP62995 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRA2BP62995 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRA2BP62995 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRA2BP62995 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRA2BP62995 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRA2BP62995 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRA2BP62995 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRA2BP62995 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRA2BP62995 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRA2BP62995 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRA2BP62995 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRA2BP62995 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRA2BP62995 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRA2BP62995 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRA2BP62995 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRA2BP62995 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRA2BP62995 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRA2BP62995 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRA2BP62995 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRA2BP62995 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRA2BP62995 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRA2BP62995 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRA2BP62995 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRA2BP62995 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRA2BP62995 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRA2BP62995 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRA2BP62995 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRA2BP62995 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRA2BP62995 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRA2BP62995 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRA2BP62995 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRA2BP62995 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRA2BP62995 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRA2BP62995 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRA2BP62995 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRA2BP62995 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRA2BP62995 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRA2BP62995 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRA2BP62995 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRA2BP62995 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRA2BP62995 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRA2BP62995 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRA2BP62995 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRA2BP62995 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRA2BP62995 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRA2BP62995 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRA2BP62995 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRA2BP62995 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRA2BP62995 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRA2BP62995 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRA2BP62995 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TRA2BP62995 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRA2BP62995 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRA2BP62995 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRA2BP62995 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRA2BP62995 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRA2BP62995 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRA2BP62995 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRA2BP62995 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRA2BP62995 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRA2BP62995 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRA2BP62995 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRA2BP62995 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRA2BP62995 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRA2BP62995 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRA2BP62995 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRA2BP62995 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRA2BP62995 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRA2BP62995 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRA2BP62995 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRA2BP62995 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRA2BP62995 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRA2BP62995 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRA2BP62995 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRA2BP62995 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRA2BP62995 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRA2BP62995 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRA2BP62995 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRA2BP62995 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRA2BP62995 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRA2BP62995 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRA2BP62995 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRA2BP62995 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRA2BP62995 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRA2BP62995 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRA2BP62995 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms