Protein–RNA interactions for Protein: P61966

AP1S1, AP-1 complex subunit sigma-1A, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S1P61966 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AP1S1P61966 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AP1S1P61966 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AP1S1P61966 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AP1S1P61966 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AP1S1P61966 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AP1S1P61966 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
AP1S1P61966 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AP1S1P61966 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AP1S1P61966 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AP1S1P61966 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AP1S1P61966 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
AP1S1P61966 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AP1S1P61966 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AP1S1P61966 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AP1S1P61966 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
AP1S1P61966 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AP1S1P61966 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AP1S1P61966 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AP1S1P61966 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
AP1S1P61966 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AP1S1P61966 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25■■□□□ 1.59
AP1S1P61966 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AP1S1P61966 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AP1S1P61966 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AP1S1P61966 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AP1S1P61966 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
AP1S1P61966 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
AP1S1P61966 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AP1S1P61966 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AP1S1P61966 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AP1S1P61966 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AP1S1P61966 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AP1S1P61966 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
AP1S1P61966 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AP1S1P61966 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AP1S1P61966 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AP1S1P61966 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AP1S1P61966 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AP1S1P61966 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AP1S1P61966 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AP1S1P61966 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AP1S1P61966 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AP1S1P61966 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AP1S1P61966 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AP1S1P61966 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AP1S1P61966 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AP1S1P61966 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AP1S1P61966 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AP1S1P61966 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AP1S1P61966 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AP1S1P61966 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AP1S1P61966 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AP1S1P61966 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP1S1P61966 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP1S1P61966 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AP1S1P61966 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AP1S1P61966 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AP1S1P61966 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AP1S1P61966 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
AP1S1P61966 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AP1S1P61966 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AP1S1P61966 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AP1S1P61966 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AP1S1P61966 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AP1S1P61966 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AP1S1P61966 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AP1S1P61966 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AP1S1P61966 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
AP1S1P61966 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AP1S1P61966 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
AP1S1P61966 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AP1S1P61966 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AP1S1P61966 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AP1S1P61966 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AP1S1P61966 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AP1S1P61966 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AP1S1P61966 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
AP1S1P61966 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
AP1S1P61966 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AP1S1P61966 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AP1S1P61966 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
AP1S1P61966 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AP1S1P61966 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AP1S1P61966 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AP1S1P61966 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AP1S1P61966 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AP1S1P61966 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AP1S1P61966 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AP1S1P61966 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AP1S1P61966 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AP1S1P61966 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AP1S1P61966 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AP1S1P61966 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AP1S1P61966 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
AP1S1P61966 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AP1S1P61966 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AP1S1P61966 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AP1S1P61966 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AP1S1P61966 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms