Protein–RNA interactions for Protein: P61163

ACTR1A, Alpha-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1AP61163 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACTR1AP61163 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACTR1AP61163 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACTR1AP61163 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACTR1AP61163 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACTR1AP61163 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACTR1AP61163 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACTR1AP61163 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACTR1AP61163 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACTR1AP61163 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ACTR1AP61163 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACTR1AP61163 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACTR1AP61163 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTR1AP61163 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTR1AP61163 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTR1AP61163 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTR1AP61163 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTR1AP61163 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ACTR1AP61163 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACTR1AP61163 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACTR1AP61163 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTR1AP61163 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTR1AP61163 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTR1AP61163 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTR1AP61163 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTR1AP61163 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTR1AP61163 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTR1AP61163 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTR1AP61163 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTR1AP61163 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTR1AP61163 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTR1AP61163 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTR1AP61163 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTR1AP61163 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTR1AP61163 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTR1AP61163 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTR1AP61163 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTR1AP61163 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTR1AP61163 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTR1AP61163 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTR1AP61163 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTR1AP61163 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTR1AP61163 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTR1AP61163 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTR1AP61163 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTR1AP61163 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTR1AP61163 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTR1AP61163 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTR1AP61163 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTR1AP61163 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTR1AP61163 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTR1AP61163 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTR1AP61163 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTR1AP61163 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTR1AP61163 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTR1AP61163 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTR1AP61163 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTR1AP61163 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTR1AP61163 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTR1AP61163 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTR1AP61163 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTR1AP61163 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTR1AP61163 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACTR1AP61163 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACTR1AP61163 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACTR1AP61163 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACTR1AP61163 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACTR1AP61163 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACTR1AP61163 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTR1AP61163 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTR1AP61163 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTR1AP61163 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTR1AP61163 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTR1AP61163 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTR1AP61163 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTR1AP61163 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTR1AP61163 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACTR1AP61163 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACTR1AP61163 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ACTR1AP61163 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACTR1AP61163 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACTR1AP61163 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACTR1AP61163 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTR1AP61163 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTR1AP61163 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTR1AP61163 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTR1AP61163 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTR1AP61163 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTR1AP61163 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTR1AP61163 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTR1AP61163 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTR1AP61163 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTR1AP61163 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTR1AP61163 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTR1AP61163 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTR1AP61163 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTR1AP61163 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTR1AP61163 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTR1AP61163 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTR1AP61163 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 269.8 ms