Protein–RNA interactions for Protein: P60953

CDC42, Cell division control protein 42 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42P60953 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC42P60953 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC42P60953 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC42P60953 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC42P60953 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC42P60953 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC42P60953 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC42P60953 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC42P60953 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC42P60953 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC42P60953 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC42P60953 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC42P60953 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC42P60953 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC42P60953 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC42P60953 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC42P60953 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC42P60953 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC42P60953 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC42P60953 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC42P60953 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC42P60953 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC42P60953 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC42P60953 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDC42P60953 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC42P60953 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC42P60953 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC42P60953 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC42P60953 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC42P60953 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC42P60953 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC42P60953 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC42P60953 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC42P60953 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC42P60953 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC42P60953 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC42P60953 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC42P60953 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC42P60953 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC42P60953 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC42P60953 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC42P60953 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC42P60953 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC42P60953 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC42P60953 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC42P60953 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC42P60953 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC42P60953 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC42P60953 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC42P60953 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC42P60953 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC42P60953 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC42P60953 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC42P60953 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC42P60953 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC42P60953 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC42P60953 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC42P60953 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC42P60953 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC42P60953 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC42P60953 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC42P60953 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC42P60953 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC42P60953 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC42P60953 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC42P60953 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC42P60953 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC42P60953 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC42P60953 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC42P60953 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC42P60953 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC42P60953 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC42P60953 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC42P60953 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC42P60953 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC42P60953 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC42P60953 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC42P60953 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC42P60953 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC42P60953 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC42P60953 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC42P60953 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC42P60953 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC42P60953 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC42P60953 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC42P60953 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC42P60953 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC42P60953 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDC42P60953 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC42P60953 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC42P60953 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC42P60953 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC42P60953 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC42P60953 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC42P60953 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC42P60953 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC42P60953 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC42P60953 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC42P60953 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC42P60953 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms