Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DCDC1P59894 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DCDC1P59894 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DCDC1P59894 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DCDC1P59894 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DCDC1P59894 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DCDC1P59894 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
DCDC1P59894 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
DCDC1P59894 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCDC1P59894 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCDC1P59894 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCDC1P59894 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCDC1P59894 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCDC1P59894 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DCDC1P59894 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DCDC1P59894 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DCDC1P59894 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DCDC1P59894 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DCDC1P59894 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DCDC1P59894 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DCDC1P59894 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DCDC1P59894 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DCDC1P59894 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
DCDC1P59894 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCDC1P59894 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCDC1P59894 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCDC1P59894 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
DCDC1P59894 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCDC1P59894 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCDC1P59894 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCDC1P59894 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DCDC1P59894 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DCDC1P59894 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DCDC1P59894 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DCDC1P59894 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
DCDC1P59894 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCDC1P59894 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCDC1P59894 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCDC1P59894 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCDC1P59894 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCDC1P59894 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCDC1P59894 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCDC1P59894 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCDC1P59894 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCDC1P59894 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCDC1P59894 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCDC1P59894 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCDC1P59894 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCDC1P59894 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCDC1P59894 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCDC1P59894 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCDC1P59894 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
DCDC1P59894 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCDC1P59894 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCDC1P59894 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCDC1P59894 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCDC1P59894 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCDC1P59894 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
DCDC1P59894 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCDC1P59894 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCDC1P59894 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCDC1P59894 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCDC1P59894 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCDC1P59894 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCDC1P59894 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCDC1P59894 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCDC1P59894 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
DCDC1P59894 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DCDC1P59894 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCDC1P59894 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCDC1P59894 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCDC1P59894 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCDC1P59894 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCDC1P59894 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DCDC1P59894 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DCDC1P59894 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DCDC1P59894 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DCDC1P59894 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DCDC1P59894 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DCDC1P59894 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DCDC1P59894 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DCDC1P59894 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCDC1P59894 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCDC1P59894 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCDC1P59894 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
DCDC1P59894 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DCDC1P59894 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DCDC1P59894 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DCDC1P59894 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DCDC1P59894 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DCDC1P59894 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DCDC1P59894 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCDC1P59894 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCDC1P59894 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCDC1P59894 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCDC1P59894 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DCDC1P59894 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCDC1P59894 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DCDC1P59894 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DCDC1P59894 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms