Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00205P59089 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00205P59089 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00205P59089 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00205P59089 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00205P59089 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00205P59089 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00205P59089 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00205P59089 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00205P59089 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00205P59089 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
LINC00205P59089 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00205P59089 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00205P59089 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00205P59089 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00205P59089 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00205P59089 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00205P59089 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00205P59089 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00205P59089 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00205P59089 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00205P59089 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00205P59089 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00205P59089 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00205P59089 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00205P59089 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00205P59089 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00205P59089 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00205P59089 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00205P59089 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00205P59089 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00205P59089 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00205P59089 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00205P59089 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00205P59089 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00205P59089 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00205P59089 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00205P59089 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00205P59089 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00205P59089 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00205P59089 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00205P59089 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00205P59089 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00205P59089 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00205P59089 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00205P59089 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00205P59089 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00205P59089 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00205P59089 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00205P59089 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00205P59089 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00205P59089 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00205P59089 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00205P59089 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00205P59089 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00205P59089 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00205P59089 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00205P59089 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00205P59089 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00205P59089 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00205P59089 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LINC00205P59089 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LINC00205P59089 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00205P59089 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00205P59089 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00205P59089 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00205P59089 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00205P59089 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00205P59089 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00205P59089 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00205P59089 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00205P59089 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00205P59089 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00205P59089 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00205P59089 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00205P59089 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00205P59089 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00205P59089 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00205P59089 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00205P59089 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00205P59089 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00205P59089 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00205P59089 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00205P59089 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00205P59089 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00205P59089 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00205P59089 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00205P59089 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00205P59089 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00205P59089 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00205P59089 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00205P59089 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00205P59089 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00205P59089 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00205P59089 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00205P59089 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00205P59089 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00205P59089 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00205P59089 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00205P59089 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms