Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SIK1P57059 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SIK1P57059 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
SIK1P57059 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SIK1P57059 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SIK1P57059 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SIK1P57059 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SIK1P57059 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
SIK1P57059 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SIK1P57059 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SIK1P57059 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SIK1P57059 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SIK1P57059 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SIK1P57059 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SIK1P57059 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SIK1P57059 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SIK1P57059 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SIK1P57059 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SIK1P57059 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
SIK1P57059 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SIK1P57059 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SIK1P57059 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
SIK1P57059 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SIK1P57059 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SIK1P57059 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SIK1P57059 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SIK1P57059 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SIK1P57059 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SIK1P57059 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SIK1P57059 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SIK1P57059 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SIK1P57059 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SIK1P57059 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SIK1P57059 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
SIK1P57059 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SIK1P57059 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SIK1P57059 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SIK1P57059 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SIK1P57059 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SIK1P57059 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SIK1P57059 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SIK1P57059 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SIK1P57059 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SIK1P57059 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SIK1P57059 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SIK1P57059 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SIK1P57059 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SIK1P57059 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SIK1P57059 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SIK1P57059 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SIK1P57059 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SIK1P57059 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SIK1P57059 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SIK1P57059 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SIK1P57059 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
SIK1P57059 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
SIK1P57059 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SIK1P57059 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
SIK1P57059 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SIK1P57059 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SIK1P57059 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SIK1P57059 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
SIK1P57059 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
SIK1P57059 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
SIK1P57059 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SIK1P57059 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC32■■■□□ 2.71
SIK1P57059 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SIK1P57059 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
SIK1P57059 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SIK1P57059 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SIK1P57059 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SIK1P57059 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SIK1P57059 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SIK1P57059 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SIK1P57059 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SIK1P57059 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SIK1P57059 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SIK1P57059 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
SIK1P57059 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SIK1P57059 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SIK1P57059 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
SIK1P57059 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SIK1P57059 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SIK1P57059 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
SIK1P57059 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
SIK1P57059 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
SIK1P57059 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
SIK1P57059 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SIK1P57059 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SIK1P57059 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SIK1P57059 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SIK1P57059 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SIK1P57059 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
SIK1P57059 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SIK1P57059 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SIK1P57059 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SIK1P57059 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
SIK1P57059 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SIK1P57059 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SIK1P57059 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms