Protein–RNA interactions for Protein: P55042

RRAD, GTP-binding protein RAD, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRADP55042 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRADP55042 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRADP55042 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRADP55042 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRADP55042 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRADP55042 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRADP55042 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRADP55042 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRADP55042 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRADP55042 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRADP55042 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRADP55042 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRADP55042 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRADP55042 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRADP55042 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRADP55042 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRADP55042 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRADP55042 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRADP55042 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRADP55042 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRADP55042 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRADP55042 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRADP55042 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRADP55042 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RRADP55042 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRADP55042 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRADP55042 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRADP55042 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRADP55042 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRADP55042 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
RRADP55042 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RRADP55042 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RRADP55042 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RRADP55042 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RRADP55042 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RRADP55042 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RRADP55042 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RRADP55042 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RRADP55042 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RRADP55042 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RRADP55042 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RRADP55042 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RRADP55042 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RRADP55042 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRADP55042 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRADP55042 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRADP55042 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RRADP55042 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RRADP55042 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RRADP55042 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRADP55042 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRADP55042 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRADP55042 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRADP55042 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRADP55042 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRADP55042 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRADP55042 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRADP55042 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RRADP55042 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRADP55042 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRADP55042 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRADP55042 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRADP55042 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RRADP55042 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RRADP55042 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRADP55042 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRADP55042 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRADP55042 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRADP55042 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRADP55042 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRADP55042 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRADP55042 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRADP55042 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRADP55042 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRADP55042 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRADP55042 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RRADP55042 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RRADP55042 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RRADP55042 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RRADP55042 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RRADP55042 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RRADP55042 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RRADP55042 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RRADP55042 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RRADP55042 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RRADP55042 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RRADP55042 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RRADP55042 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RRADP55042 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RRADP55042 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RRADP55042 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RRADP55042 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RRADP55042 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RRADP55042 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRADP55042 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RRADP55042 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRADP55042 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRADP55042 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRADP55042 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRADP55042 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms