Protein–RNA interactions for Protein: P55036

PSMD4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD4P55036 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD4P55036 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD4P55036 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD4P55036 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMD4P55036 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMD4P55036 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMD4P55036 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMD4P55036 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD4P55036 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD4P55036 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD4P55036 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD4P55036 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD4P55036 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD4P55036 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD4P55036 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD4P55036 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD4P55036 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD4P55036 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD4P55036 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD4P55036 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD4P55036 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD4P55036 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD4P55036 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD4P55036 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD4P55036 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD4P55036 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD4P55036 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD4P55036 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD4P55036 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD4P55036 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD4P55036 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD4P55036 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMD4P55036 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMD4P55036 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMD4P55036 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMD4P55036 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMD4P55036 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMD4P55036 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMD4P55036 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMD4P55036 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMD4P55036 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMD4P55036 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMD4P55036 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMD4P55036 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSMD4P55036 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSMD4P55036 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMD4P55036 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMD4P55036 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMD4P55036 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMD4P55036 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMD4P55036 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMD4P55036 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMD4P55036 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMD4P55036 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMD4P55036 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMD4P55036 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMD4P55036 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMD4P55036 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMD4P55036 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMD4P55036 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD4P55036 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD4P55036 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD4P55036 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD4P55036 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD4P55036 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD4P55036 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD4P55036 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD4P55036 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD4P55036 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD4P55036 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD4P55036 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD4P55036 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD4P55036 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMD4P55036 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMD4P55036 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PSMD4P55036 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD4P55036 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD4P55036 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD4P55036 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD4P55036 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD4P55036 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD4P55036 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD4P55036 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD4P55036 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD4P55036 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD4P55036 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD4P55036 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD4P55036 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMD4P55036 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMD4P55036 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMD4P55036 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMD4P55036 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMD4P55036 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMD4P55036 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMD4P55036 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMD4P55036 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMD4P55036 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMD4P55036 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMD4P55036 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMD4P55036 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms