Protein–RNA interactions for Protein: P54840

GYS2, Glycogen [starch] synthase, liver, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GYS2P54840 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GYS2P54840 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GYS2P54840 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GYS2P54840 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GYS2P54840 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GYS2P54840 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GYS2P54840 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GYS2P54840 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GYS2P54840 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GYS2P54840 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GYS2P54840 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GYS2P54840 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GYS2P54840 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GYS2P54840 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GYS2P54840 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GYS2P54840 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GYS2P54840 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GYS2P54840 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GYS2P54840 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GYS2P54840 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GYS2P54840 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GYS2P54840 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GYS2P54840 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GYS2P54840 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GYS2P54840 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GYS2P54840 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GYS2P54840 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GYS2P54840 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GYS2P54840 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GYS2P54840 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GYS2P54840 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GYS2P54840 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GYS2P54840 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GYS2P54840 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GYS2P54840 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GYS2P54840 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GYS2P54840 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GYS2P54840 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GYS2P54840 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GYS2P54840 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GYS2P54840 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GYS2P54840 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GYS2P54840 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GYS2P54840 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GYS2P54840 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GYS2P54840 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GYS2P54840 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GYS2P54840 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GYS2P54840 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GYS2P54840 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GYS2P54840 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GYS2P54840 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GYS2P54840 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GYS2P54840 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GYS2P54840 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GYS2P54840 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GYS2P54840 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GYS2P54840 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GYS2P54840 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GYS2P54840 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GYS2P54840 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GYS2P54840 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GYS2P54840 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GYS2P54840 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GYS2P54840 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GYS2P54840 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GYS2P54840 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GYS2P54840 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GYS2P54840 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GYS2P54840 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GYS2P54840 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GYS2P54840 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GYS2P54840 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GYS2P54840 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GYS2P54840 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GYS2P54840 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GYS2P54840 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GYS2P54840 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GYS2P54840 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GYS2P54840 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GYS2P54840 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GYS2P54840 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GYS2P54840 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GYS2P54840 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GYS2P54840 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GYS2P54840 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GYS2P54840 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GYS2P54840 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GYS2P54840 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GYS2P54840 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GYS2P54840 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GYS2P54840 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GYS2P54840 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GYS2P54840 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
GYS2P54840 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GYS2P54840 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GYS2P54840 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GYS2P54840 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GYS2P54840 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GYS2P54840 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms