Protein–RNA interactions for Protein: P53438

SOK2, Protein SOK2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SOK2P53438 CTL1YMR180C 963 nt7.33□□□□□ -1.24
SOK2P53438 PMT7YDR307W 1989 nt7.33□□□□□ -1.24
SOK2P53438 PRP40YKL012W 1752 nt7.33□□□□□ -1.24
SOK2P53438 VBA3YCL069W 1377 nt7.33□□□□□ -1.24
SOK2P53438 DPB2YPR175W 2070 nt7.32□□□□□ -1.24
SOK2P53438 CTF3YLR381W 2202 nt7.32□□□□□ -1.24
SOK2P53438 BEM1YBR200W 1656 nt7.32□□□□□ -1.24
SOK2P53438 TGA1tA(UGC)A 73 nt7.32□□□□□ -1.24
SOK2P53438 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt7.32□□□□□ -1.24
SOK2P53438 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt7.32□□□□□ -1.24
SOK2P53438 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt7.32□□□□□ -1.24
SOK2P53438 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt7.32□□□□□ -1.24
SOK2P53438 SWM1YDR260C 513 nt7.32□□□□□ -1.24
SOK2P53438 MRP1YDR347W 966 nt7.32□□□□□ -1.24
SOK2P53438 SUT1YGL162W 900 nt7.32□□□□□ -1.24
SOK2P53438 YHL045WYHL045W 348 nt7.32□□□□□ -1.24
SOK2P53438 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt7.32□□□□□ -1.24
SOK2P53438 RPN5YDL147W 1338 nt7.31□□□□□ -1.24
SOK2P53438 HVG1YER039C 750 nt7.31□□□□□ -1.24
SOK2P53438 SRP102YKL154W 735 nt7.31□□□□□ -1.24
SOK2P53438 RCR1YBR005W 642 nt7.31□□□□□ -1.24
SOK2P53438 IRC14YOR135C 342 nt7.31□□□□□ -1.24
SOK2P53438 FCY1YPR062W 477 nt7.31□□□□□ -1.24
SOK2P53438 HAS1YMR290C 1518 nt7.31□□□□□ -1.24
SOK2P53438 YLR072WYLR072W 2082 nt7.31□□□□□ -1.24
SOK2P53438 APM4YOL062C 1476 nt7.3□□□□□ -1.24
SOK2P53438 POP4YBR257W 840 nt7.3□□□□□ -1.24
SOK2P53438 ERO1YML130C 1692 nt7.3□□□□□ -1.24
SOK2P53438 FRA1YLL029W 2250 nt7.3□□□□□ -1.24
SOK2P53438 BRL1YHR036W 1416 nt7.29□□□□□ -1.24
SOK2P53438 SKI6YGR195W 741 nt7.29□□□□□ -1.24
SOK2P53438 YGR210CYGR210C 1236 nt7.29□□□□□ -1.24
SOK2P53438 YMR253CYMR253C 1245 nt7.29□□□□□ -1.24
SOK2P53438 YGP1YNL160W 1065 nt7.29□□□□□ -1.24
SOK2P53438 MDM10YAL010C 1482 nt7.29□□□□□ -1.24
SOK2P53438 ERR3YMR323W 1314 nt7.28□□□□□ -1.24
SOK2P53438 ERR1YOR393W 1314 nt7.28□□□□□ -1.24
SOK2P53438 ERR2YPL281C 1314 nt7.28□□□□□ -1.24
SOK2P53438 GNP1YDR508C 1992 nt7.28□□□□□ -1.24
SOK2P53438 YDL121CYDL121C 450 nt7.28□□□□□ -1.24
SOK2P53438 YDR222WYDR222W 1248 nt7.28□□□□□ -1.24
SOK2P53438 ARI1YGL157W 1044 nt7.28□□□□□ -1.24
SOK2P53438 YIR043CYIR043C 693 nt7.28□□□□□ -1.24
SOK2P53438 ARG3YJL088W 1017 nt7.28□□□□□ -1.24
SOK2P53438 MRS4YKR052C 915 nt7.28□□□□□ -1.24
SOK2P53438 YPT11YNL304W 1254 nt7.28□□□□□ -1.24
SOK2P53438 CSG2YBR036C 1233 nt7.28□□□□□ -1.24
SOK2P53438 ARL3YPL051W 597 nt7.28□□□□□ -1.24
SOK2P53438 YPL068CYPL068C 882 nt7.28□□□□□ -1.24
SOK2P53438 KGD2YDR148C 1392 nt7.28□□□□□ -1.24
SOK2P53438 SAN1YDR143C 1833 nt7.27□□□□□ -1.25
SOK2P53438 HMRA1YCR097W 381 nt7.27□□□□□ -1.25
SOK2P53438 DCD1YHR144C 939 nt7.27□□□□□ -1.25
SOK2P53438 YJR096WYJR096W 849 nt7.27□□□□□ -1.25
SOK2P53438 HCR1YLR192C 798 nt7.27□□□□□ -1.25
SOK2P53438 CIT2YCR005C 1383 nt7.27□□□□□ -1.25
SOK2P53438 SPO77YLR341W 1434 nt7.27□□□□□ -1.25
SOK2P53438 RTG2YGL252C 1767 nt7.26□□□□□ -1.25
SOK2P53438 YDR029WYDR029W 315 nt7.26□□□□□ -1.25
SOK2P53438 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt7.26□□□□□ -1.25
SOK2P53438 TIP41YPR040W 1071 nt7.26□□□□□ -1.25
SOK2P53438 GLE1YDL207W 1617 nt7.26□□□□□ -1.25
SOK2P53438 PMA2YPL036W 2844 nt7.26□□□□□ -1.25
SOK2P53438 SHE9YDR393W 1371 nt7.25□□□□□ -1.25
SOK2P53438 YCR016WYCR016W 873 nt7.25□□□□□ -1.25
SOK2P53438 YDR541CYDR541C 1035 nt7.25□□□□□ -1.25
SOK2P53438 COG7YGL005C 840 nt7.25□□□□□ -1.25
SOK2P53438 DCG1YIR030C 735 nt7.25□□□□□ -1.25
SOK2P53438 SUI2YJR007W 915 nt7.25□□□□□ -1.25
SOK2P53438 RSM7YJR113C 744 nt7.25□□□□□ -1.25
SOK2P53438 MFA2YNL145W 117 nt7.25□□□□□ -1.25
SOK2P53438 CSL4YNL232W 879 nt7.25□□□□□ -1.25
SOK2P53438 TIF5YPR041W 1218 nt7.25□□□□□ -1.25
SOK2P53438 NDE1YMR145C 1683 nt7.25□□□□□ -1.25
SOK2P53438 MST1YKL194C 1389 nt7.24□□□□□ -1.25
SOK2P53438 GGA2YHR108W 1758 nt7.24□□□□□ -1.25
SOK2P53438 SBP1YHL034C 885 nt7.24□□□□□ -1.25
SOK2P53438 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt7.24□□□□□ -1.25
SOK2P53438 TIF2YJL138C 1188 nt7.24□□□□□ -1.25
SOK2P53438 TIF1YKR059W 1188 nt7.24□□□□□ -1.25
SOK2P53438 YLR118CYLR118C 684 nt7.24□□□□□ -1.25
SOK2P53438 CUS2YNL286W 858 nt7.24□□□□□ -1.25
SOK2P53438 YHR131CYHR131C 2553 nt7.24□□□□□ -1.25
SOK2P53438 GAS1YMR307W 1680 nt7.24□□□□□ -1.25
SOK2P53438 THI3YDL080C 1830 nt7.24□□□□□ -1.25
SOK2P53438 PTC6YCR079W 1329 nt7.24□□□□□ -1.25
SOK2P53438 PEX7YDR142C 1128 nt7.23□□□□□ -1.25
SOK2P53438 YFR020WYFR020W 699 nt7.23□□□□□ -1.25
SOK2P53438 GTO1YGR154C 1071 nt7.23□□□□□ -1.25
SOK2P53438 YLR366WYLR366W 306 nt7.23□□□□□ -1.25
SOK2P53438 YOL050CYOL050C 321 nt7.23□□□□□ -1.25
SOK2P53438 YER152CYER152C 1332 nt7.23□□□□□ -1.25
SOK2P53438 HXT9YJL219W 1704 nt7.22□□□□□ -1.25
SOK2P53438 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.22□□□□□ -1.25
SOK2P53438 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.22□□□□□ -1.25
SOK2P53438 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.22□□□□□ -1.25
SOK2P53438 snR86snR86 1004 nt7.22□□□□□ -1.25
SOK2P53438 SHR3YDL212W 633 nt7.22□□□□□ -1.25
SOK2P53438 PHM8YER037W 966 nt7.22□□□□□ -1.25
SOK2P53438 YER152W-AYER152W-A 567 nt7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 58.3 ms