Protein–RNA interactions for Protein: P52747

ZNF143, Zinc finger protein 143, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF143P52747 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF143P52747 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF143P52747 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF143P52747 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF143P52747 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF143P52747 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF143P52747 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF143P52747 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF143P52747 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF143P52747 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF143P52747 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF143P52747 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF143P52747 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF143P52747 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF143P52747 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF143P52747 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF143P52747 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF143P52747 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF143P52747 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF143P52747 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF143P52747 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF143P52747 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF143P52747 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF143P52747 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF143P52747 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF143P52747 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF143P52747 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF143P52747 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF143P52747 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF143P52747 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF143P52747 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF143P52747 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF143P52747 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF143P52747 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF143P52747 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF143P52747 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF143P52747 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF143P52747 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF143P52747 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF143P52747 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF143P52747 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF143P52747 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF143P52747 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF143P52747 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF143P52747 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF143P52747 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF143P52747 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF143P52747 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF143P52747 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF143P52747 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF143P52747 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF143P52747 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF143P52747 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF143P52747 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF143P52747 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF143P52747 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF143P52747 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF143P52747 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF143P52747 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF143P52747 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF143P52747 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF143P52747 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF143P52747 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF143P52747 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF143P52747 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF143P52747 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF143P52747 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF143P52747 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF143P52747 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF143P52747 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF143P52747 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF143P52747 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF143P52747 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF143P52747 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF143P52747 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF143P52747 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF143P52747 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
ZNF143P52747 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF143P52747 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF143P52747 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF143P52747 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF143P52747 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF143P52747 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF143P52747 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF143P52747 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF143P52747 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF143P52747 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF143P52747 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF143P52747 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF143P52747 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF143P52747 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF143P52747 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF143P52747 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF143P52747 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF143P52747 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF143P52747 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF143P52747 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF143P52747 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF143P52747 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF143P52747 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms