Protein–RNA interactions for Protein: P51790

CLCN3, H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3P51790 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLCN3P51790 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLCN3P51790 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLCN3P51790 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLCN3P51790 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CLCN3P51790 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLCN3P51790 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLCN3P51790 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLCN3P51790 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLCN3P51790 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLCN3P51790 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLCN3P51790 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CLCN3P51790 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLCN3P51790 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLCN3P51790 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLCN3P51790 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLCN3P51790 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLCN3P51790 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLCN3P51790 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLCN3P51790 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CLCN3P51790 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CLCN3P51790 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLCN3P51790 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLCN3P51790 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CLCN3P51790 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLCN3P51790 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLCN3P51790 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLCN3P51790 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLCN3P51790 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLCN3P51790 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLCN3P51790 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLCN3P51790 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLCN3P51790 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLCN3P51790 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLCN3P51790 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CLCN3P51790 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CLCN3P51790 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLCN3P51790 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLCN3P51790 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CLCN3P51790 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLCN3P51790 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLCN3P51790 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLCN3P51790 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLCN3P51790 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CLCN3P51790 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLCN3P51790 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLCN3P51790 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLCN3P51790 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CLCN3P51790 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLCN3P51790 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLCN3P51790 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLCN3P51790 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLCN3P51790 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLCN3P51790 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLCN3P51790 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CLCN3P51790 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLCN3P51790 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CLCN3P51790 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CLCN3P51790 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLCN3P51790 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLCN3P51790 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLCN3P51790 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLCN3P51790 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLCN3P51790 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CLCN3P51790 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLCN3P51790 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLCN3P51790 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLCN3P51790 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLCN3P51790 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLCN3P51790 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLCN3P51790 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLCN3P51790 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLCN3P51790 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLCN3P51790 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLCN3P51790 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CLCN3P51790 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLCN3P51790 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLCN3P51790 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLCN3P51790 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLCN3P51790 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLCN3P51790 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLCN3P51790 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLCN3P51790 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLCN3P51790 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CLCN3P51790 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLCN3P51790 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLCN3P51790 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLCN3P51790 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLCN3P51790 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLCN3P51790 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLCN3P51790 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLCN3P51790 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLCN3P51790 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CLCN3P51790 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLCN3P51790 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLCN3P51790 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLCN3P51790 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLCN3P51790 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLCN3P51790 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLCN3P51790 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms