Protein–RNA interactions for Protein: P51513

NOVA1, RNA-binding protein Nova-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOVA1P51513 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOVA1P51513 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOVA1P51513 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NOVA1P51513 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOVA1P51513 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOVA1P51513 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOVA1P51513 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOVA1P51513 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOVA1P51513 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOVA1P51513 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOVA1P51513 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOVA1P51513 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOVA1P51513 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOVA1P51513 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOVA1P51513 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOVA1P51513 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOVA1P51513 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NOVA1P51513 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOVA1P51513 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NOVA1P51513 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NOVA1P51513 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOVA1P51513 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOVA1P51513 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOVA1P51513 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOVA1P51513 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOVA1P51513 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOVA1P51513 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOVA1P51513 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NOVA1P51513 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOVA1P51513 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOVA1P51513 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOVA1P51513 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOVA1P51513 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOVA1P51513 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOVA1P51513 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOVA1P51513 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOVA1P51513 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOVA1P51513 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOVA1P51513 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOVA1P51513 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOVA1P51513 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOVA1P51513 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOVA1P51513 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOVA1P51513 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOVA1P51513 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOVA1P51513 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NOVA1P51513 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NOVA1P51513 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NOVA1P51513 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NOVA1P51513 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NOVA1P51513 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NOVA1P51513 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NOVA1P51513 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NOVA1P51513 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NOVA1P51513 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NOVA1P51513 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NOVA1P51513 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NOVA1P51513 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NOVA1P51513 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NOVA1P51513 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NOVA1P51513 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NOVA1P51513 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NOVA1P51513 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NOVA1P51513 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NOVA1P51513 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NOVA1P51513 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NOVA1P51513 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NOVA1P51513 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NOVA1P51513 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NOVA1P51513 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NOVA1P51513 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NOVA1P51513 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NOVA1P51513 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NOVA1P51513 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NOVA1P51513 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NOVA1P51513 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NOVA1P51513 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NOVA1P51513 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NOVA1P51513 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NOVA1P51513 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NOVA1P51513 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NOVA1P51513 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NOVA1P51513 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NOVA1P51513 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NOVA1P51513 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NOVA1P51513 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NOVA1P51513 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NOVA1P51513 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NOVA1P51513 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NOVA1P51513 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NOVA1P51513 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NOVA1P51513 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NOVA1P51513 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NOVA1P51513 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NOVA1P51513 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NOVA1P51513 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NOVA1P51513 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NOVA1P51513 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NOVA1P51513 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NOVA1P51513 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms