Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
NUP153P49790 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
NUP153P49790 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
NUP153P49790 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC39.25■■■■□ 3.87
NUP153P49790 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
NUP153P49790 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
NUP153P49790 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
NUP153P49790 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
NUP153P49790 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
NUP153P49790 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
NUP153P49790 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
NUP153P49790 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
NUP153P49790 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
NUP153P49790 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
NUP153P49790 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
NUP153P49790 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
NUP153P49790 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
NUP153P49790 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
NUP153P49790 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
NUP153P49790 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC39.2■■■■□ 3.87
NUP153P49790 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
NUP153P49790 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
NUP153P49790 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
NUP153P49790 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
NUP153P49790 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
NUP153P49790 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
NUP153P49790 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
NUP153P49790 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
NUP153P49790 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
NUP153P49790 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
NUP153P49790 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
NUP153P49790 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
NUP153P49790 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
NUP153P49790 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
NUP153P49790 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
NUP153P49790 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
NUP153P49790 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
NUP153P49790 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
NUP153P49790 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.15■■■■□ 3.86
NUP153P49790 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
NUP153P49790 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
NUP153P49790 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
NUP153P49790 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC39.14■■■■□ 3.86
NUP153P49790 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
NUP153P49790 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
NUP153P49790 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
NUP153P49790 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
NUP153P49790 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
NUP153P49790 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
NUP153P49790 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
NUP153P49790 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
NUP153P49790 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
NUP153P49790 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC39.1■■■■□ 3.85
NUP153P49790 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC39.1■■■■□ 3.85
NUP153P49790 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
NUP153P49790 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
NUP153P49790 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
NUP153P49790 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
NUP153P49790 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
NUP153P49790 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
NUP153P49790 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC39.07■■■■□ 3.85
NUP153P49790 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC39.07■■■■□ 3.85
NUP153P49790 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC39.07■■■■□ 3.85
NUP153P49790 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
NUP153P49790 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC39.07■■■■□ 3.85
NUP153P49790 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
NUP153P49790 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
NUP153P49790 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
NUP153P49790 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC39.06■■■■□ 3.84
NUP153P49790 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
NUP153P49790 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC39.05■■■■□ 3.84
NUP153P49790 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC39.05■■■■□ 3.84
NUP153P49790 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
NUP153P49790 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC39.05■■■■□ 3.84
NUP153P49790 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC39.05■■■■□ 3.84
NUP153P49790 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
NUP153P49790 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
NUP153P49790 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
NUP153P49790 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
NUP153P49790 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
NUP153P49790 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.02■■■■□ 3.84
NUP153P49790 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
NUP153P49790 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC39.02■■■■□ 3.84
NUP153P49790 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.84
NUP153P49790 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.83
NUP153P49790 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
NUP153P49790 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
NUP153P49790 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC38.99■■■■□ 3.83
NUP153P49790 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
NUP153P49790 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
NUP153P49790 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
NUP153P49790 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
NUP153P49790 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
NUP153P49790 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
NUP153P49790 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC38.97■■■■□ 3.83
NUP153P49790 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC38.97■■■■□ 3.83
NUP153P49790 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
NUP153P49790 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
NUP153P49790 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
NUP153P49790 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms