Protein–RNA interactions for Protein: P49767

VEGFC, Vascular endothelial growth factor C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFCP49767 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VEGFCP49767 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFCP49767 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFCP49767 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFCP49767 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFCP49767 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFCP49767 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VEGFCP49767 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VEGFCP49767 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VEGFCP49767 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
VEGFCP49767 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
VEGFCP49767 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VEGFCP49767 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VEGFCP49767 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VEGFCP49767 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VEGFCP49767 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VEGFCP49767 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VEGFCP49767 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VEGFCP49767 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VEGFCP49767 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VEGFCP49767 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VEGFCP49767 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VEGFCP49767 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VEGFCP49767 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VEGFCP49767 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VEGFCP49767 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VEGFCP49767 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VEGFCP49767 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VEGFCP49767 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
VEGFCP49767 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VEGFCP49767 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VEGFCP49767 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VEGFCP49767 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VEGFCP49767 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
VEGFCP49767 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VEGFCP49767 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VEGFCP49767 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VEGFCP49767 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VEGFCP49767 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VEGFCP49767 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
VEGFCP49767 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
VEGFCP49767 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VEGFCP49767 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VEGFCP49767 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VEGFCP49767 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VEGFCP49767 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VEGFCP49767 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VEGFCP49767 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VEGFCP49767 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VEGFCP49767 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VEGFCP49767 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VEGFCP49767 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
VEGFCP49767 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VEGFCP49767 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VEGFCP49767 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VEGFCP49767 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VEGFCP49767 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VEGFCP49767 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VEGFCP49767 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
VEGFCP49767 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VEGFCP49767 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VEGFCP49767 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VEGFCP49767 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VEGFCP49767 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VEGFCP49767 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VEGFCP49767 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VEGFCP49767 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VEGFCP49767 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VEGFCP49767 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VEGFCP49767 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VEGFCP49767 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VEGFCP49767 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VEGFCP49767 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VEGFCP49767 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VEGFCP49767 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VEGFCP49767 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
VEGFCP49767 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
VEGFCP49767 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VEGFCP49767 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VEGFCP49767 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VEGFCP49767 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VEGFCP49767 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VEGFCP49767 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
VEGFCP49767 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VEGFCP49767 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VEGFCP49767 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VEGFCP49767 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VEGFCP49767 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VEGFCP49767 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VEGFCP49767 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VEGFCP49767 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VEGFCP49767 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VEGFCP49767 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VEGFCP49767 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VEGFCP49767 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
VEGFCP49767 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VEGFCP49767 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VEGFCP49767 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VEGFCP49767 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VEGFCP49767 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms