Protein–RNA interactions for Protein: P48553

TRAPPC10, Trafficking protein particle complex subunit 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10P48553 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRAPPC10P48553 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRAPPC10P48553 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRAPPC10P48553 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRAPPC10P48553 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRAPPC10P48553 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRAPPC10P48553 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TRAPPC10P48553 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRAPPC10P48553 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TRAPPC10P48553 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRAPPC10P48553 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRAPPC10P48553 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRAPPC10P48553 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRAPPC10P48553 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRAPPC10P48553 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRAPPC10P48553 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRAPPC10P48553 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRAPPC10P48553 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAPPC10P48553 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAPPC10P48553 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAPPC10P48553 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAPPC10P48553 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAPPC10P48553 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAPPC10P48553 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAPPC10P48553 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAPPC10P48553 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRAPPC10P48553 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRAPPC10P48553 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRAPPC10P48553 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRAPPC10P48553 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRAPPC10P48553 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRAPPC10P48553 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRAPPC10P48553 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRAPPC10P48553 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRAPPC10P48553 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRAPPC10P48553 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRAPPC10P48553 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRAPPC10P48553 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRAPPC10P48553 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRAPPC10P48553 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRAPPC10P48553 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRAPPC10P48553 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TRAPPC10P48553 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRAPPC10P48553 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRAPPC10P48553 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRAPPC10P48553 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRAPPC10P48553 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRAPPC10P48553 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRAPPC10P48553 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRAPPC10P48553 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAPPC10P48553 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAPPC10P48553 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAPPC10P48553 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAPPC10P48553 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAPPC10P48553 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAPPC10P48553 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAPPC10P48553 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRAPPC10P48553 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRAPPC10P48553 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRAPPC10P48553 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRAPPC10P48553 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAPPC10P48553 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAPPC10P48553 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAPPC10P48553 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAPPC10P48553 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAPPC10P48553 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAPPC10P48553 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAPPC10P48553 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAPPC10P48553 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAPPC10P48553 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAPPC10P48553 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAPPC10P48553 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAPPC10P48553 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRAPPC10P48553 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRAPPC10P48553 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAPPC10P48553 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAPPC10P48553 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAPPC10P48553 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRAPPC10P48553 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRAPPC10P48553 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRAPPC10P48553 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRAPPC10P48553 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRAPPC10P48553 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRAPPC10P48553 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRAPPC10P48553 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRAPPC10P48553 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAPPC10P48553 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAPPC10P48553 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAPPC10P48553 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAPPC10P48553 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAPPC10P48553 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAPPC10P48553 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAPPC10P48553 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAPPC10P48553 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAPPC10P48553 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAPPC10P48553 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAPPC10P48553 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAPPC10P48553 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TRAPPC10P48553 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
TRAPPC10P48553 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms