Protein–RNA interactions for Protein: P46781

RPS9, 40S ribosomal protein S9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS9P46781 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPS9P46781 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPS9P46781 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPS9P46781 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPS9P46781 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPS9P46781 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RPS9P46781 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RPS9P46781 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RPS9P46781 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RPS9P46781 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RPS9P46781 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPS9P46781 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPS9P46781 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPS9P46781 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RPS9P46781 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPS9P46781 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPS9P46781 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPS9P46781 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPS9P46781 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPS9P46781 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPS9P46781 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPS9P46781 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPS9P46781 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPS9P46781 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPS9P46781 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RPS9P46781 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPS9P46781 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPS9P46781 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPS9P46781 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPS9P46781 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPS9P46781 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RPS9P46781 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPS9P46781 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RPS9P46781 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPS9P46781 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPS9P46781 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPS9P46781 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPS9P46781 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPS9P46781 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPS9P46781 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPS9P46781 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPS9P46781 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPS9P46781 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RPS9P46781 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPS9P46781 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPS9P46781 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPS9P46781 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPS9P46781 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPS9P46781 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPS9P46781 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RPS9P46781 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RPS9P46781 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RPS9P46781 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPS9P46781 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPS9P46781 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPS9P46781 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RPS9P46781 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPS9P46781 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPS9P46781 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPS9P46781 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RPS9P46781 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPS9P46781 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPS9P46781 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPS9P46781 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPS9P46781 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPS9P46781 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPS9P46781 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPS9P46781 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPS9P46781 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPS9P46781 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPS9P46781 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPS9P46781 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPS9P46781 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RPS9P46781 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPS9P46781 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPS9P46781 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RPS9P46781 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPS9P46781 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPS9P46781 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS9P46781 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS9P46781 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS9P46781 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS9P46781 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS9P46781 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS9P46781 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS9P46781 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS9P46781 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RPS9P46781 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPS9P46781 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
RPS9P46781 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPS9P46781 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPS9P46781 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPS9P46781 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPS9P46781 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RPS9P46781 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPS9P46781 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPS9P46781 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPS9P46781 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPS9P46781 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPS9P46781 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms