Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MTHFRP42898 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MTHFRP42898 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MTHFRP42898 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MTHFRP42898 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MTHFRP42898 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MTHFRP42898 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MTHFRP42898 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MTHFRP42898 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MTHFRP42898 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MTHFRP42898 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MTHFRP42898 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MTHFRP42898 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MTHFRP42898 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MTHFRP42898 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MTHFRP42898 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MTHFRP42898 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MTHFRP42898 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
MTHFRP42898 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MTHFRP42898 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MTHFRP42898 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MTHFRP42898 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MTHFRP42898 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MTHFRP42898 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MTHFRP42898 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MTHFRP42898 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MTHFRP42898 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
MTHFRP42898 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MTHFRP42898 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MTHFRP42898 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MTHFRP42898 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MTHFRP42898 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MTHFRP42898 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MTHFRP42898 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MTHFRP42898 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MTHFRP42898 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MTHFRP42898 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MTHFRP42898 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MTHFRP42898 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MTHFRP42898 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MTHFRP42898 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MTHFRP42898 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MTHFRP42898 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
MTHFRP42898 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MTHFRP42898 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MTHFRP42898 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MTHFRP42898 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MTHFRP42898 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MTHFRP42898 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MTHFRP42898 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
MTHFRP42898 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MTHFRP42898 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MTHFRP42898 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MTHFRP42898 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTHFRP42898 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTHFRP42898 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTHFRP42898 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MTHFRP42898 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MTHFRP42898 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MTHFRP42898 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MTHFRP42898 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MTHFRP42898 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MTHFRP42898 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MTHFRP42898 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
MTHFRP42898 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MTHFRP42898 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MTHFRP42898 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MTHFRP42898 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTHFRP42898 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTHFRP42898 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTHFRP42898 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTHFRP42898 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
MTHFRP42898 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTHFRP42898 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
MTHFRP42898 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTHFRP42898 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTHFRP42898 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTHFRP42898 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTHFRP42898 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTHFRP42898 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTHFRP42898 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTHFRP42898 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTHFRP42898 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
MTHFRP42898 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MTHFRP42898 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
MTHFRP42898 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTHFRP42898 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTHFRP42898 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTHFRP42898 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MTHFRP42898 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MTHFRP42898 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MTHFRP42898 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MTHFRP42898 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MTHFRP42898 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MTHFRP42898 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MTHFRP42898 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MTHFRP42898 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTHFRP42898 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTHFRP42898 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTHFRP42898 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms