Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPGP40121 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPGP40121 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPGP40121 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPGP40121 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPGP40121 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPGP40121 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPGP40121 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPGP40121 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPGP40121 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPGP40121 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPGP40121 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPGP40121 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPGP40121 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPGP40121 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPGP40121 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPGP40121 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPGP40121 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPGP40121 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPGP40121 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPGP40121 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPGP40121 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPGP40121 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPGP40121 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPGP40121 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPGP40121 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPGP40121 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPGP40121 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPGP40121 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPGP40121 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPGP40121 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPGP40121 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPGP40121 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPGP40121 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPGP40121 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPGP40121 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPGP40121 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPGP40121 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPGP40121 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPGP40121 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPGP40121 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPGP40121 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPGP40121 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPGP40121 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPGP40121 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPGP40121 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPGP40121 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPGP40121 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPGP40121 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPGP40121 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPGP40121 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPGP40121 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPGP40121 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPGP40121 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPGP40121 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPGP40121 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPGP40121 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CAPGP40121 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CAPGP40121 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPGP40121 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPGP40121 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPGP40121 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPGP40121 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPGP40121 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPGP40121 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPGP40121 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPGP40121 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPGP40121 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPGP40121 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPGP40121 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPGP40121 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPGP40121 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPGP40121 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPGP40121 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPGP40121 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPGP40121 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPGP40121 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPGP40121 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPGP40121 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPGP40121 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPGP40121 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPGP40121 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPGP40121 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPGP40121 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPGP40121 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPGP40121 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPGP40121 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPGP40121 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPGP40121 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAPGP40121 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAPGP40121 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPGP40121 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPGP40121 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPGP40121 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPGP40121 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPGP40121 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPGP40121 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPGP40121 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPGP40121 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPGP40121 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms