Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
ITGAEP38570 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
ITGAEP38570 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
ITGAEP38570 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
ITGAEP38570 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
ITGAEP38570 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
ITGAEP38570 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
ITGAEP38570 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
ITGAEP38570 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
ITGAEP38570 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
ITGAEP38570 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
ITGAEP38570 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
ITGAEP38570 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
ITGAEP38570 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
ITGAEP38570 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
ITGAEP38570 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
ITGAEP38570 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
ITGAEP38570 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
ITGAEP38570 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
ITGAEP38570 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
ITGAEP38570 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
ITGAEP38570 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
ITGAEP38570 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
ITGAEP38570 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
ITGAEP38570 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
ITGAEP38570 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
ITGAEP38570 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
ITGAEP38570 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
ITGAEP38570 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
ITGAEP38570 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
ITGAEP38570 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
ITGAEP38570 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
ITGAEP38570 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
ITGAEP38570 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
ITGAEP38570 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
ITGAEP38570 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
ITGAEP38570 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
ITGAEP38570 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
ITGAEP38570 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
ITGAEP38570 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
ITGAEP38570 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
ITGAEP38570 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
ITGAEP38570 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
ITGAEP38570 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
ITGAEP38570 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
ITGAEP38570 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.6
ITGAEP38570 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
ITGAEP38570 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.59
ITGAEP38570 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
ITGAEP38570 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
ITGAEP38570 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
ITGAEP38570 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
ITGAEP38570 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
ITGAEP38570 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
ITGAEP38570 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
ITGAEP38570 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
ITGAEP38570 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
ITGAEP38570 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
ITGAEP38570 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC37.48■■■■□ 3.59
ITGAEP38570 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
ITGAEP38570 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
ITGAEP38570 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
ITGAEP38570 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
ITGAEP38570 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
ITGAEP38570 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
ITGAEP38570 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
ITGAEP38570 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
ITGAEP38570 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
ITGAEP38570 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
ITGAEP38570 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.58
ITGAEP38570 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
ITGAEP38570 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC37.44■■■■□ 3.58
ITGAEP38570 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
ITGAEP38570 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
ITGAEP38570 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
ITGAEP38570 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
ITGAEP38570 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
ITGAEP38570 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
ITGAEP38570 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
ITGAEP38570 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
ITGAEP38570 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
ITGAEP38570 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
ITGAEP38570 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
ITGAEP38570 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
ITGAEP38570 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
ITGAEP38570 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
ITGAEP38570 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
ITGAEP38570 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
ITGAEP38570 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
ITGAEP38570 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
ITGAEP38570 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
ITGAEP38570 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
ITGAEP38570 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
ITGAEP38570 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
ITGAEP38570 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
ITGAEP38570 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
ITGAEP38570 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
ITGAEP38570 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
ITGAEP38570 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
ITGAEP38570 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms