Protein–RNA interactions for Protein: P37235

HPCAL1, Hippocalcin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAL1P37235 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPCAL1P37235 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPCAL1P37235 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPCAL1P37235 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPCAL1P37235 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPCAL1P37235 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HPCAL1P37235 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPCAL1P37235 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPCAL1P37235 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPCAL1P37235 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPCAL1P37235 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPCAL1P37235 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPCAL1P37235 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPCAL1P37235 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HPCAL1P37235 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPCAL1P37235 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPCAL1P37235 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPCAL1P37235 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HPCAL1P37235 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HPCAL1P37235 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HPCAL1P37235 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HPCAL1P37235 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HPCAL1P37235 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HPCAL1P37235 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HPCAL1P37235 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HPCAL1P37235 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HPCAL1P37235 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPCAL1P37235 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPCAL1P37235 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPCAL1P37235 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPCAL1P37235 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPCAL1P37235 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPCAL1P37235 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPCAL1P37235 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPCAL1P37235 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPCAL1P37235 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPCAL1P37235 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPCAL1P37235 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPCAL1P37235 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPCAL1P37235 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPCAL1P37235 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPCAL1P37235 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPCAL1P37235 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HPCAL1P37235 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HPCAL1P37235 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HPCAL1P37235 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HPCAL1P37235 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HPCAL1P37235 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HPCAL1P37235 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HPCAL1P37235 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HPCAL1P37235 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HPCAL1P37235 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HPCAL1P37235 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
HPCAL1P37235 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HPCAL1P37235 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPCAL1P37235 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPCAL1P37235 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPCAL1P37235 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HPCAL1P37235 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HPCAL1P37235 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HPCAL1P37235 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HPCAL1P37235 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPCAL1P37235 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPCAL1P37235 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPCAL1P37235 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPCAL1P37235 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPCAL1P37235 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPCAL1P37235 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPCAL1P37235 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPCAL1P37235 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPCAL1P37235 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPCAL1P37235 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPCAL1P37235 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPCAL1P37235 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPCAL1P37235 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPCAL1P37235 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPCAL1P37235 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPCAL1P37235 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPCAL1P37235 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPCAL1P37235 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPCAL1P37235 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HPCAL1P37235 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPCAL1P37235 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPCAL1P37235 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPCAL1P37235 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPCAL1P37235 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPCAL1P37235 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HPCAL1P37235 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HPCAL1P37235 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HPCAL1P37235 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HPCAL1P37235 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HPCAL1P37235 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HPCAL1P37235 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPCAL1P37235 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPCAL1P37235 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPCAL1P37235 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPCAL1P37235 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPCAL1P37235 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPCAL1P37235 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPCAL1P37235 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms