Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTNNB1P35222 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTNNB1P35222 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTNNB1P35222 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTNNB1P35222 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTNNB1P35222 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CTNNB1P35222 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CTNNB1P35222 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTNNB1P35222 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTNNB1P35222 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTNNB1P35222 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CTNNB1P35222 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CTNNB1P35222 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTNNB1P35222 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTNNB1P35222 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTNNB1P35222 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CTNNB1P35222 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTNNB1P35222 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTNNB1P35222 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTNNB1P35222 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTNNB1P35222 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTNNB1P35222 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CTNNB1P35222 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTNNB1P35222 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTNNB1P35222 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTNNB1P35222 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTNNB1P35222 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTNNB1P35222 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTNNB1P35222 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CTNNB1P35222 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CTNNB1P35222 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CTNNB1P35222 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CTNNB1P35222 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTNNB1P35222 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTNNB1P35222 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTNNB1P35222 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTNNB1P35222 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTNNB1P35222 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTNNB1P35222 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTNNB1P35222 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTNNB1P35222 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTNNB1P35222 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTNNB1P35222 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTNNB1P35222 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CTNNB1P35222 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CTNNB1P35222 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CTNNB1P35222 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CTNNB1P35222 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CTNNB1P35222 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CTNNB1P35222 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CTNNB1P35222 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTNNB1P35222 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTNNB1P35222 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTNNB1P35222 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTNNB1P35222 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTNNB1P35222 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CTNNB1P35222 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTNNB1P35222 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CTNNB1P35222 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTNNB1P35222 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTNNB1P35222 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTNNB1P35222 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CTNNB1P35222 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CTNNB1P35222 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CTNNB1P35222 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CTNNB1P35222 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CTNNB1P35222 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CTNNB1P35222 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CTNNB1P35222 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CTNNB1P35222 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CTNNB1P35222 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CTNNB1P35222 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTNNB1P35222 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTNNB1P35222 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTNNB1P35222 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTNNB1P35222 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTNNB1P35222 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTNNB1P35222 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTNNB1P35222 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTNNB1P35222 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTNNB1P35222 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTNNB1P35222 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CTNNB1P35222 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CTNNB1P35222 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CTNNB1P35222 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CTNNB1P35222 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CTNNB1P35222 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CTNNB1P35222 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CTNNB1P35222 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CTNNB1P35222 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CTNNB1P35222 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CTNNB1P35222 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CTNNB1P35222 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CTNNB1P35222 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CTNNB1P35222 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CTNNB1P35222 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTNNB1P35222 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTNNB1P35222 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTNNB1P35222 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTNNB1P35222 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms