Protein–RNA interactions for Protein: P33992

MCM5, DNA replication licensing factor MCM5, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM5P33992 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MCM5P33992 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MCM5P33992 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MCM5P33992 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
MCM5P33992 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MCM5P33992 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MCM5P33992 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MCM5P33992 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
MCM5P33992 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MCM5P33992 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MCM5P33992 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MCM5P33992 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MCM5P33992 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MCM5P33992 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MCM5P33992 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MCM5P33992 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MCM5P33992 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
MCM5P33992 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MCM5P33992 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MCM5P33992 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MCM5P33992 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MCM5P33992 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MCM5P33992 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MCM5P33992 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MCM5P33992 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MCM5P33992 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MCM5P33992 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MCM5P33992 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MCM5P33992 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MCM5P33992 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MCM5P33992 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MCM5P33992 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MCM5P33992 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MCM5P33992 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MCM5P33992 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MCM5P33992 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MCM5P33992 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MCM5P33992 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MCM5P33992 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MCM5P33992 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MCM5P33992 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MCM5P33992 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MCM5P33992 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MCM5P33992 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MCM5P33992 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MCM5P33992 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MCM5P33992 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MCM5P33992 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MCM5P33992 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MCM5P33992 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
MCM5P33992 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MCM5P33992 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MCM5P33992 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MCM5P33992 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MCM5P33992 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MCM5P33992 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MCM5P33992 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MCM5P33992 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MCM5P33992 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
MCM5P33992 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MCM5P33992 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MCM5P33992 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MCM5P33992 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MCM5P33992 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MCM5P33992 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MCM5P33992 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MCM5P33992 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MCM5P33992 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MCM5P33992 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MCM5P33992 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MCM5P33992 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MCM5P33992 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MCM5P33992 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MCM5P33992 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MCM5P33992 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MCM5P33992 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MCM5P33992 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MCM5P33992 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MCM5P33992 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
MCM5P33992 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MCM5P33992 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MCM5P33992 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MCM5P33992 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MCM5P33992 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MCM5P33992 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MCM5P33992 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MCM5P33992 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MCM5P33992 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MCM5P33992 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MCM5P33992 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MCM5P33992 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MCM5P33992 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
MCM5P33992 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MCM5P33992 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MCM5P33992 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MCM5P33992 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MCM5P33992 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MCM5P33992 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MCM5P33992 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MCM5P33992 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms