Protein–RNA interactions for Protein: P32248

CCR7, C-C chemokine receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR7P32248 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCR7P32248 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCR7P32248 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCR7P32248 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCR7P32248 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCR7P32248 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCR7P32248 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCR7P32248 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCR7P32248 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCR7P32248 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCR7P32248 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCR7P32248 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCR7P32248 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCR7P32248 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCR7P32248 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCR7P32248 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCR7P32248 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCR7P32248 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCR7P32248 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCR7P32248 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCR7P32248 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCR7P32248 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCR7P32248 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCR7P32248 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCR7P32248 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCR7P32248 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCR7P32248 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCR7P32248 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCR7P32248 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCR7P32248 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCR7P32248 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCR7P32248 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCR7P32248 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCR7P32248 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCR7P32248 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCR7P32248 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCR7P32248 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCR7P32248 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCR7P32248 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCR7P32248 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCR7P32248 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCR7P32248 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCR7P32248 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCR7P32248 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCR7P32248 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCR7P32248 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCR7P32248 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCR7P32248 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCR7P32248 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCR7P32248 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCR7P32248 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCR7P32248 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCR7P32248 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCR7P32248 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCR7P32248 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCR7P32248 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCR7P32248 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCR7P32248 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCR7P32248 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCR7P32248 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCR7P32248 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCR7P32248 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCR7P32248 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCR7P32248 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCR7P32248 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCR7P32248 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCR7P32248 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCR7P32248 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCR7P32248 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCR7P32248 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCR7P32248 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCR7P32248 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCR7P32248 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCR7P32248 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCR7P32248 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCR7P32248 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCR7P32248 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCR7P32248 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCR7P32248 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCR7P32248 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCR7P32248 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCR7P32248 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCR7P32248 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCR7P32248 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCR7P32248 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCR7P32248 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCR7P32248 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCR7P32248 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCR7P32248 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCR7P32248 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCR7P32248 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCR7P32248 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCR7P32248 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCR7P32248 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCR7P32248 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCR7P32248 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCR7P32248 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCR7P32248 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCR7P32248 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCR7P32248 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms