Protein–RNA interactions for Protein: P32246

CCR1, C-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR1P32246 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCR1P32246 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCR1P32246 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCR1P32246 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCR1P32246 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCR1P32246 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCR1P32246 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCR1P32246 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCR1P32246 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCR1P32246 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCR1P32246 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCR1P32246 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCR1P32246 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCR1P32246 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCR1P32246 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCR1P32246 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCR1P32246 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCR1P32246 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCR1P32246 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCR1P32246 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCR1P32246 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCR1P32246 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CCR1P32246 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCR1P32246 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCR1P32246 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCR1P32246 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCR1P32246 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCR1P32246 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCR1P32246 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCR1P32246 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCR1P32246 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCR1P32246 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CCR1P32246 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCR1P32246 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCR1P32246 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCR1P32246 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CCR1P32246 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCR1P32246 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCR1P32246 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCR1P32246 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCR1P32246 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCR1P32246 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCR1P32246 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCR1P32246 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCR1P32246 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCR1P32246 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCR1P32246 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCR1P32246 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCR1P32246 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCR1P32246 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CCR1P32246 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCR1P32246 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCR1P32246 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCR1P32246 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCR1P32246 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCR1P32246 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCR1P32246 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCR1P32246 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCR1P32246 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCR1P32246 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCR1P32246 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCR1P32246 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCR1P32246 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCR1P32246 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCR1P32246 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCR1P32246 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCR1P32246 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCR1P32246 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCR1P32246 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCR1P32246 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCR1P32246 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCR1P32246 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CCR1P32246 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCR1P32246 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCR1P32246 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCR1P32246 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCR1P32246 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCR1P32246 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCR1P32246 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCR1P32246 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCR1P32246 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCR1P32246 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCR1P32246 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCR1P32246 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CCR1P32246 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCR1P32246 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCR1P32246 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCR1P32246 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCR1P32246 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCR1P32246 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCR1P32246 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCR1P32246 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCR1P32246 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCR1P32246 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCR1P32246 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCR1P32246 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCR1P32246 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCR1P32246 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CCR1P32246 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCR1P32246 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms