Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXA9P31269 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXA9P31269 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXA9P31269 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXA9P31269 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXA9P31269 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXA9P31269 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXA9P31269 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXA9P31269 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXA9P31269 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXA9P31269 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXA9P31269 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXA9P31269 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXA9P31269 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXA9P31269 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXA9P31269 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXA9P31269 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXA9P31269 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXA9P31269 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXA9P31269 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXA9P31269 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
HOXA9P31269 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXA9P31269 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXA9P31269 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXA9P31269 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXA9P31269 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXA9P31269 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXA9P31269 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXA9P31269 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXA9P31269 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXA9P31269 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXA9P31269 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXA9P31269 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXA9P31269 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXA9P31269 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXA9P31269 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXA9P31269 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXA9P31269 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXA9P31269 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXA9P31269 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXA9P31269 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXA9P31269 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXA9P31269 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXA9P31269 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXA9P31269 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXA9P31269 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXA9P31269 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXA9P31269 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXA9P31269 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXA9P31269 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HOXA9P31269 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HOXA9P31269 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXA9P31269 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXA9P31269 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXA9P31269 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXA9P31269 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXA9P31269 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXA9P31269 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXA9P31269 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXA9P31269 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXA9P31269 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXA9P31269 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXA9P31269 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXA9P31269 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXA9P31269 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXA9P31269 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXA9P31269 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXA9P31269 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXA9P31269 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXA9P31269 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXA9P31269 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXA9P31269 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXA9P31269 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXA9P31269 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXA9P31269 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXA9P31269 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXA9P31269 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXA9P31269 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXA9P31269 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXA9P31269 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXA9P31269 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXA9P31269 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXA9P31269 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXA9P31269 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXA9P31269 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXA9P31269 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXA9P31269 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXA9P31269 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXA9P31269 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXA9P31269 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXA9P31269 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXA9P31269 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXA9P31269 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXA9P31269 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXA9P31269 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXA9P31269 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXA9P31269 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXA9P31269 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXA9P31269 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXA9P31269 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms