Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXA6P31267 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOXA6P31267 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HOXA6P31267 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXA6P31267 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXA6P31267 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXA6P31267 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXA6P31267 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXA6P31267 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXA6P31267 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXA6P31267 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXA6P31267 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXA6P31267 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXA6P31267 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXA6P31267 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA6P31267 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA6P31267 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA6P31267 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA6P31267 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA6P31267 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA6P31267 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXA6P31267 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXA6P31267 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXA6P31267 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HOXA6P31267 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXA6P31267 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXA6P31267 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXA6P31267 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXA6P31267 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXA6P31267 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXA6P31267 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXA6P31267 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXA6P31267 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXA6P31267 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXA6P31267 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXA6P31267 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXA6P31267 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXA6P31267 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXA6P31267 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXA6P31267 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXA6P31267 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXA6P31267 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXA6P31267 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXA6P31267 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXA6P31267 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXA6P31267 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXA6P31267 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXA6P31267 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXA6P31267 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXA6P31267 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXA6P31267 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXA6P31267 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXA6P31267 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXA6P31267 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HOXA6P31267 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXA6P31267 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXA6P31267 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXA6P31267 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXA6P31267 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXA6P31267 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXA6P31267 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXA6P31267 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXA6P31267 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXA6P31267 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXA6P31267 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXA6P31267 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXA6P31267 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXA6P31267 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXA6P31267 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXA6P31267 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXA6P31267 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXA6P31267 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXA6P31267 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXA6P31267 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXA6P31267 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXA6P31267 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXA6P31267 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXA6P31267 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXA6P31267 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXA6P31267 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXA6P31267 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXA6P31267 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXA6P31267 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HOXA6P31267 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
HOXA6P31267 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HOXA6P31267 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA6P31267 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA6P31267 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA6P31267 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA6P31267 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA6P31267 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA6P31267 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA6P31267 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA6P31267 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA6P31267 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA6P31267 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA6P31267 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA6P31267 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA6P31267 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA6P31267 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms