Protein–RNA interactions for Protein: P29323

EPHB2, Ephrin type-B receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB2P29323 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EPHB2P29323 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EPHB2P29323 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EPHB2P29323 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EPHB2P29323 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EPHB2P29323 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EPHB2P29323 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EPHB2P29323 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EPHB2P29323 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EPHB2P29323 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EPHB2P29323 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EPHB2P29323 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EPHB2P29323 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EPHB2P29323 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EPHB2P29323 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EPHB2P29323 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EPHB2P29323 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EPHB2P29323 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EPHB2P29323 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EPHB2P29323 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EPHB2P29323 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EPHB2P29323 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EPHB2P29323 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EPHB2P29323 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EPHB2P29323 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EPHB2P29323 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EPHB2P29323 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EPHB2P29323 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
EPHB2P29323 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EPHB2P29323 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EPHB2P29323 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EPHB2P29323 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EPHB2P29323 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EPHB2P29323 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EPHB2P29323 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EPHB2P29323 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EPHB2P29323 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EPHB2P29323 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EPHB2P29323 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EPHB2P29323 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
EPHB2P29323 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
EPHB2P29323 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EPHB2P29323 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EPHB2P29323 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EPHB2P29323 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EPHB2P29323 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EPHB2P29323 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EPHB2P29323 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EPHB2P29323 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EPHB2P29323 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EPHB2P29323 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EPHB2P29323 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EPHB2P29323 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EPHB2P29323 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EPHB2P29323 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EPHB2P29323 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EPHB2P29323 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EPHB2P29323 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EPHB2P29323 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EPHB2P29323 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EPHB2P29323 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EPHB2P29323 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EPHB2P29323 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EPHB2P29323 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EPHB2P29323 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EPHB2P29323 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EPHB2P29323 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
EPHB2P29323 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EPHB2P29323 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EPHB2P29323 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EPHB2P29323 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EPHB2P29323 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EPHB2P29323 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EPHB2P29323 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EPHB2P29323 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EPHB2P29323 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EPHB2P29323 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EPHB2P29323 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EPHB2P29323 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EPHB2P29323 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EPHB2P29323 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EPHB2P29323 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EPHB2P29323 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EPHB2P29323 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
EPHB2P29323 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EPHB2P29323 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EPHB2P29323 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EPHB2P29323 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EPHB2P29323 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EPHB2P29323 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EPHB2P29323 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EPHB2P29323 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EPHB2P29323 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EPHB2P29323 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EPHB2P29323 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EPHB2P29323 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EPHB2P29323 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EPHB2P29323 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EPHB2P29323 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EPHB2P29323 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms