Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-DMAP28067 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-DMAP28067 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-DMAP28067 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-DMAP28067 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-DMAP28067 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-DMAP28067 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-DMAP28067 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-DMAP28067 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-DMAP28067 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-DMAP28067 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-DMAP28067 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-DMAP28067 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-DMAP28067 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-DMAP28067 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-DMAP28067 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-DMAP28067 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-DMAP28067 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
HLA-DMAP28067 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-DMAP28067 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-DMAP28067 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-DMAP28067 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-DMAP28067 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-DMAP28067 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-DMAP28067 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-DMAP28067 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-DMAP28067 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-DMAP28067 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-DMAP28067 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-DMAP28067 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-DMAP28067 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-DMAP28067 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-DMAP28067 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-DMAP28067 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-DMAP28067 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-DMAP28067 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-DMAP28067 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HLA-DMAP28067 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HLA-DMAP28067 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HLA-DMAP28067 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HLA-DMAP28067 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HLA-DMAP28067 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HLA-DMAP28067 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HLA-DMAP28067 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HLA-DMAP28067 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HLA-DMAP28067 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HLA-DMAP28067 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
HLA-DMAP28067 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HLA-DMAP28067 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLA-DMAP28067 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLA-DMAP28067 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLA-DMAP28067 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLA-DMAP28067 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLA-DMAP28067 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLA-DMAP28067 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLA-DMAP28067 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLA-DMAP28067 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLA-DMAP28067 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLA-DMAP28067 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLA-DMAP28067 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLA-DMAP28067 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLA-DMAP28067 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLA-DMAP28067 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HLA-DMAP28067 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HLA-DMAP28067 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HLA-DMAP28067 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HLA-DMAP28067 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HLA-DMAP28067 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HLA-DMAP28067 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HLA-DMAP28067 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HLA-DMAP28067 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HLA-DMAP28067 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HLA-DMAP28067 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HLA-DMAP28067 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HLA-DMAP28067 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HLA-DMAP28067 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HLA-DMAP28067 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-DMAP28067 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-DMAP28067 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-DMAP28067 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-DMAP28067 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-DMAP28067 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-DMAP28067 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-DMAP28067 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-DMAP28067 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-DMAP28067 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-DMAP28067 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-DMAP28067 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HLA-DMAP28067 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HLA-DMAP28067 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HLA-DMAP28067 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HLA-DMAP28067 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HLA-DMAP28067 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HLA-DMAP28067 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HLA-DMAP28067 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HLA-DMAP28067 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HLA-DMAP28067 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HLA-DMAP28067 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HLA-DMAP28067 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HLA-DMAP28067 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms