Protein–RNA interactions for Protein: P26045

PTPN3, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3P26045 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN3P26045 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN3P26045 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN3P26045 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN3P26045 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN3P26045 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN3P26045 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN3P26045 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN3P26045 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN3P26045 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN3P26045 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN3P26045 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPN3P26045 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPN3P26045 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPN3P26045 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPN3P26045 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPN3P26045 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPN3P26045 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPN3P26045 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPN3P26045 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPN3P26045 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN3P26045 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN3P26045 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN3P26045 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN3P26045 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN3P26045 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN3P26045 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPN3P26045 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPN3P26045 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPN3P26045 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPN3P26045 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPN3P26045 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPN3P26045 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPN3P26045 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPN3P26045 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPN3P26045 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN3P26045 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN3P26045 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN3P26045 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN3P26045 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN3P26045 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPN3P26045 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPN3P26045 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPN3P26045 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPN3P26045 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN3P26045 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN3P26045 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN3P26045 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN3P26045 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPN3P26045 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPN3P26045 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPN3P26045 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPN3P26045 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPN3P26045 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPN3P26045 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPN3P26045 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN3P26045 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN3P26045 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN3P26045 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN3P26045 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN3P26045 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN3P26045 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN3P26045 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN3P26045 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN3P26045 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN3P26045 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN3P26045 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN3P26045 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN3P26045 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN3P26045 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN3P26045 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN3P26045 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN3P26045 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN3P26045 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN3P26045 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN3P26045 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN3P26045 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPN3P26045 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPN3P26045 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPN3P26045 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPN3P26045 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPN3P26045 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPN3P26045 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPN3P26045 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPN3P26045 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPN3P26045 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPN3P26045 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPN3P26045 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPN3P26045 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPN3P26045 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN3P26045 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN3P26045 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN3P26045 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN3P26045 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN3P26045 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN3P26045 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPN3P26045 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPN3P26045 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPN3P26045 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN3P26045 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms