Protein–RNA interactions for Protein: P26010

ITGB7, Integrin beta-7, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB7P26010 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB7P26010 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB7P26010 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB7P26010 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGB7P26010 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGB7P26010 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGB7P26010 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGB7P26010 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB7P26010 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB7P26010 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB7P26010 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB7P26010 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB7P26010 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB7P26010 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB7P26010 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB7P26010 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB7P26010 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB7P26010 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB7P26010 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB7P26010 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB7P26010 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGB7P26010 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGB7P26010 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGB7P26010 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGB7P26010 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGB7P26010 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGB7P26010 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGB7P26010 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGB7P26010 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGB7P26010 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGB7P26010 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGB7P26010 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGB7P26010 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGB7P26010 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGB7P26010 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGB7P26010 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGB7P26010 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGB7P26010 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ITGB7P26010 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB7P26010 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB7P26010 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB7P26010 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB7P26010 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB7P26010 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB7P26010 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB7P26010 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB7P26010 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB7P26010 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB7P26010 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB7P26010 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB7P26010 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB7P26010 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB7P26010 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB7P26010 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB7P26010 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB7P26010 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGB7P26010 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGB7P26010 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGB7P26010 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGB7P26010 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGB7P26010 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGB7P26010 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGB7P26010 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB7P26010 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB7P26010 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB7P26010 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB7P26010 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB7P26010 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB7P26010 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB7P26010 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB7P26010 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB7P26010 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB7P26010 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGB7P26010 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGB7P26010 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGB7P26010 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGB7P26010 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGB7P26010 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGB7P26010 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGB7P26010 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGB7P26010 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGB7P26010 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGB7P26010 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGB7P26010 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGB7P26010 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGB7P26010 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGB7P26010 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGB7P26010 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGB7P26010 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGB7P26010 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGB7P26010 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGB7P26010 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGB7P26010 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGB7P26010 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGB7P26010 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGB7P26010 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGB7P26010 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGB7P26010 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGB7P26010 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGB7P26010 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123 ms