Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
KDELR1P24390 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDELR1P24390 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDELR1P24390 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
KDELR1P24390 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDELR1P24390 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KDELR1P24390 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KDELR1P24390 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KDELR1P24390 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KDELR1P24390 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
KDELR1P24390 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
KDELR1P24390 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KDELR1P24390 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDELR1P24390 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
KDELR1P24390 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
KDELR1P24390 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDELR1P24390 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDELR1P24390 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDELR1P24390 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDELR1P24390 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDELR1P24390 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDELR1P24390 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDELR1P24390 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDELR1P24390 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KDELR1P24390 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KDELR1P24390 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KDELR1P24390 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KDELR1P24390 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KDELR1P24390 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KDELR1P24390 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KDELR1P24390 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KDELR1P24390 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KDELR1P24390 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KDELR1P24390 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KDELR1P24390 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDELR1P24390 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDELR1P24390 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDELR1P24390 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDELR1P24390 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDELR1P24390 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDELR1P24390 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDELR1P24390 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDELR1P24390 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDELR1P24390 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
KDELR1P24390 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
KDELR1P24390 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDELR1P24390 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDELR1P24390 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDELR1P24390 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KDELR1P24390 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KDELR1P24390 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDELR1P24390 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDELR1P24390 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDELR1P24390 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDELR1P24390 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDELR1P24390 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDELR1P24390 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDELR1P24390 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDELR1P24390 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDELR1P24390 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDELR1P24390 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
KDELR1P24390 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDELR1P24390 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDELR1P24390 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDELR1P24390 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDELR1P24390 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDELR1P24390 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDELR1P24390 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDELR1P24390 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDELR1P24390 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDELR1P24390 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDELR1P24390 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDELR1P24390 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDELR1P24390 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDELR1P24390 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDELR1P24390 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDELR1P24390 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDELR1P24390 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
KDELR1P24390 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDELR1P24390 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDELR1P24390 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDELR1P24390 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDELR1P24390 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDELR1P24390 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDELR1P24390 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDELR1P24390 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDELR1P24390 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
KDELR1P24390 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDELR1P24390 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
KDELR1P24390 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDELR1P24390 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDELR1P24390 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDELR1P24390 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDELR1P24390 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDELR1P24390 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDELR1P24390 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDELR1P24390 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDELR1P24390 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDELR1P24390 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDELR1P24390 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms