Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3BP20337 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB3BP20337 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB3BP20337 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB3BP20337 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB3BP20337 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB3BP20337 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB3BP20337 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB3BP20337 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB3BP20337 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB3BP20337 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB3BP20337 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB3BP20337 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB3BP20337 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB3BP20337 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB3BP20337 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB3BP20337 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB3BP20337 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB3BP20337 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB3BP20337 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB3BP20337 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB3BP20337 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB3BP20337 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB3BP20337 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB3BP20337 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB3BP20337 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB3BP20337 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB3BP20337 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB3BP20337 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB3BP20337 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB3BP20337 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB3BP20337 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB3BP20337 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB3BP20337 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB3BP20337 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB3BP20337 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB3BP20337 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB3BP20337 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB3BP20337 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB3BP20337 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB3BP20337 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB3BP20337 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB3BP20337 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB3BP20337 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB3BP20337 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB3BP20337 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB3BP20337 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB3BP20337 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB3BP20337 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB3BP20337 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB3BP20337 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB3BP20337 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB3BP20337 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB3BP20337 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB3BP20337 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB3BP20337 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB3BP20337 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB3BP20337 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB3BP20337 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB3BP20337 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB3BP20337 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB3BP20337 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB3BP20337 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB3BP20337 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB3BP20337 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB3BP20337 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB3BP20337 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB3BP20337 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB3BP20337 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB3BP20337 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB3BP20337 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB3BP20337 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB3BP20337 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB3BP20337 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB3BP20337 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB3BP20337 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB3BP20337 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3BP20337 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3BP20337 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3BP20337 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3BP20337 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3BP20337 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3BP20337 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3BP20337 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3BP20337 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB3BP20337 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB3BP20337 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB3BP20337 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB3BP20337 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB3BP20337 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB3BP20337 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB3BP20337 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB3BP20337 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3BP20337 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3BP20337 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3BP20337 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3BP20337 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3BP20337 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3BP20337 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3BP20337 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms