Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SDSP20132 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SDSP20132 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SDSP20132 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SDSP20132 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SDSP20132 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SDSP20132 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SDSP20132 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SDSP20132 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SDSP20132 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SDSP20132 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SDSP20132 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SDSP20132 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SDSP20132 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SDSP20132 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SDSP20132 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SDSP20132 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SDSP20132 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SDSP20132 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SDSP20132 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
SDSP20132 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SDSP20132 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SDSP20132 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SDSP20132 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SDSP20132 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
SDSP20132 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SDSP20132 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SDSP20132 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SDSP20132 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SDSP20132 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SDSP20132 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SDSP20132 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SDSP20132 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
SDSP20132 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SDSP20132 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SDSP20132 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SDSP20132 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SDSP20132 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SDSP20132 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
SDSP20132 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
SDSP20132 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SDSP20132 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SDSP20132 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SDSP20132 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SDSP20132 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SDSP20132 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SDSP20132 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SDSP20132 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SDSP20132 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SDSP20132 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SDSP20132 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SDSP20132 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SDSP20132 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SDSP20132 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
SDSP20132 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SDSP20132 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SDSP20132 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SDSP20132 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SDSP20132 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SDSP20132 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SDSP20132 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SDSP20132 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SDSP20132 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SDSP20132 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SDSP20132 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
SDSP20132 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SDSP20132 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SDSP20132 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SDSP20132 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SDSP20132 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SDSP20132 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SDSP20132 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SDSP20132 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SDSP20132 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
SDSP20132 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SDSP20132 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SDSP20132 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SDSP20132 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SDSP20132 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SDSP20132 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SDSP20132 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SDSP20132 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SDSP20132 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SDSP20132 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SDSP20132 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SDSP20132 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SDSP20132 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SDSP20132 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SDSP20132 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SDSP20132 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SDSP20132 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SDSP20132 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SDSP20132 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SDSP20132 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SDSP20132 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SDSP20132 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SDSP20132 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SDSP20132 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SDSP20132 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SDSP20132 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms