Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CD58P19256 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CD58P19256 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CD58P19256 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CD58P19256 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CD58P19256 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CD58P19256 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CD58P19256 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CD58P19256 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CD58P19256 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CD58P19256 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CD58P19256 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CD58P19256 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CD58P19256 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CD58P19256 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CD58P19256 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CD58P19256 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CD58P19256 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CD58P19256 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CD58P19256 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CD58P19256 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CD58P19256 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CD58P19256 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CD58P19256 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CD58P19256 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CD58P19256 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CD58P19256 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CD58P19256 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CD58P19256 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CD58P19256 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CD58P19256 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CD58P19256 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CD58P19256 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CD58P19256 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CD58P19256 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CD58P19256 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CD58P19256 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CD58P19256 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CD58P19256 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CD58P19256 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CD58P19256 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CD58P19256 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CD58P19256 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CD58P19256 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CD58P19256 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CD58P19256 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CD58P19256 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CD58P19256 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CD58P19256 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CD58P19256 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CD58P19256 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CD58P19256 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CD58P19256 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CD58P19256 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CD58P19256 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CD58P19256 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CD58P19256 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CD58P19256 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CD58P19256 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CD58P19256 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CD58P19256 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CD58P19256 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CD58P19256 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CD58P19256 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CD58P19256 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CD58P19256 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CD58P19256 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CD58P19256 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CD58P19256 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CD58P19256 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CD58P19256 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CD58P19256 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CD58P19256 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CD58P19256 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CD58P19256 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CD58P19256 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CD58P19256 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CD58P19256 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CD58P19256 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CD58P19256 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CD58P19256 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CD58P19256 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CD58P19256 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CD58P19256 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CD58P19256 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CD58P19256 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CD58P19256 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CD58P19256 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CD58P19256 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CD58P19256 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CD58P19256 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CD58P19256 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CD58P19256 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CD58P19256 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CD58P19256 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CD58P19256 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CD58P19256 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CD58P19256 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CD58P19256 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CD58P19256 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms