Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LYL1P12980 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LYL1P12980 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LYL1P12980 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LYL1P12980 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LYL1P12980 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LYL1P12980 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LYL1P12980 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LYL1P12980 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LYL1P12980 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LYL1P12980 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LYL1P12980 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LYL1P12980 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LYL1P12980 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LYL1P12980 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
LYL1P12980 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LYL1P12980 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LYL1P12980 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LYL1P12980 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LYL1P12980 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LYL1P12980 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LYL1P12980 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LYL1P12980 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYL1P12980 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYL1P12980 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYL1P12980 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYL1P12980 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYL1P12980 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LYL1P12980 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYL1P12980 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYL1P12980 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYL1P12980 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYL1P12980 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LYL1P12980 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYL1P12980 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYL1P12980 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYL1P12980 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LYL1P12980 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYL1P12980 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYL1P12980 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYL1P12980 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LYL1P12980 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYL1P12980 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYL1P12980 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYL1P12980 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYL1P12980 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYL1P12980 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYL1P12980 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYL1P12980 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYL1P12980 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYL1P12980 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYL1P12980 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYL1P12980 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYL1P12980 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYL1P12980 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYL1P12980 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYL1P12980 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYL1P12980 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYL1P12980 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYL1P12980 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYL1P12980 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYL1P12980 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LYL1P12980 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYL1P12980 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LYL1P12980 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LYL1P12980 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LYL1P12980 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LYL1P12980 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LYL1P12980 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LYL1P12980 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LYL1P12980 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LYL1P12980 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LYL1P12980 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LYL1P12980 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LYL1P12980 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LYL1P12980 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LYL1P12980 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LYL1P12980 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LYL1P12980 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LYL1P12980 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LYL1P12980 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LYL1P12980 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LYL1P12980 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LYL1P12980 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LYL1P12980 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LYL1P12980 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LYL1P12980 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LYL1P12980 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LYL1P12980 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LYL1P12980 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LYL1P12980 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LYL1P12980 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LYL1P12980 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LYL1P12980 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LYL1P12980 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LYL1P12980 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LYL1P12980 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LYL1P12980 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LYL1P12980 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LYL1P12980 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms