Protein–RNA interactions for Protein: P0DKX4

SMIM18, Small integral membrane protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM18P0DKX4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMIM18P0DKX4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMIM18P0DKX4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SMIM18P0DKX4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMIM18P0DKX4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMIM18P0DKX4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMIM18P0DKX4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMIM18P0DKX4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMIM18P0DKX4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMIM18P0DKX4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMIM18P0DKX4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMIM18P0DKX4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMIM18P0DKX4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMIM18P0DKX4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMIM18P0DKX4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMIM18P0DKX4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM18P0DKX4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM18P0DKX4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM18P0DKX4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM18P0DKX4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM18P0DKX4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM18P0DKX4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM18P0DKX4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMIM18P0DKX4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMIM18P0DKX4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMIM18P0DKX4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMIM18P0DKX4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM18P0DKX4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM18P0DKX4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM18P0DKX4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM18P0DKX4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM18P0DKX4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM18P0DKX4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM18P0DKX4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM18P0DKX4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMIM18P0DKX4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM18P0DKX4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM18P0DKX4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM18P0DKX4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM18P0DKX4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM18P0DKX4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM18P0DKX4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM18P0DKX4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM18P0DKX4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM18P0DKX4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMIM18P0DKX4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMIM18P0DKX4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMIM18P0DKX4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMIM18P0DKX4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMIM18P0DKX4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM18P0DKX4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM18P0DKX4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM18P0DKX4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM18P0DKX4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM18P0DKX4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM18P0DKX4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM18P0DKX4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMIM18P0DKX4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SMIM18P0DKX4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMIM18P0DKX4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMIM18P0DKX4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMIM18P0DKX4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMIM18P0DKX4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMIM18P0DKX4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM18P0DKX4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM18P0DKX4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM18P0DKX4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM18P0DKX4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM18P0DKX4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM18P0DKX4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM18P0DKX4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMIM18P0DKX4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMIM18P0DKX4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMIM18P0DKX4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMIM18P0DKX4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM18P0DKX4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM18P0DKX4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM18P0DKX4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM18P0DKX4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM18P0DKX4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM18P0DKX4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM18P0DKX4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM18P0DKX4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM18P0DKX4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM18P0DKX4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM18P0DKX4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM18P0DKX4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM18P0DKX4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM18P0DKX4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM18P0DKX4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM18P0DKX4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM18P0DKX4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM18P0DKX4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM18P0DKX4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM18P0DKX4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM18P0DKX4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMIM18P0DKX4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMIM18P0DKX4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMIM18P0DKX4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMIM18P0DKX4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1562.8 ms