Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC172P0C7W6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC172P0C7W6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC172P0C7W6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC172P0C7W6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC172P0C7W6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC172P0C7W6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC172P0C7W6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC172P0C7W6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC172P0C7W6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC172P0C7W6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC172P0C7W6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC172P0C7W6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC172P0C7W6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC172P0C7W6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC172P0C7W6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC172P0C7W6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC172P0C7W6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC172P0C7W6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC172P0C7W6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC172P0C7W6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC172P0C7W6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC172P0C7W6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC172P0C7W6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC172P0C7W6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC172P0C7W6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC172P0C7W6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC172P0C7W6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC172P0C7W6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC172P0C7W6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC172P0C7W6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC172P0C7W6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC172P0C7W6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC172P0C7W6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC172P0C7W6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC172P0C7W6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC172P0C7W6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC172P0C7W6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC172P0C7W6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC172P0C7W6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC172P0C7W6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC172P0C7W6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC172P0C7W6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC172P0C7W6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC172P0C7W6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC172P0C7W6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC172P0C7W6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC172P0C7W6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC172P0C7W6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC172P0C7W6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC172P0C7W6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC172P0C7W6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC172P0C7W6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC172P0C7W6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC172P0C7W6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC172P0C7W6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC172P0C7W6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC172P0C7W6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC172P0C7W6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC172P0C7W6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC172P0C7W6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC172P0C7W6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC172P0C7W6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC172P0C7W6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC172P0C7W6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC172P0C7W6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC172P0C7W6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC172P0C7W6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC172P0C7W6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC172P0C7W6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC172P0C7W6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC172P0C7W6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC172P0C7W6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC172P0C7W6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC172P0C7W6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC172P0C7W6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC172P0C7W6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC172P0C7W6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC172P0C7W6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC172P0C7W6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC172P0C7W6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC172P0C7W6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC172P0C7W6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC172P0C7W6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC172P0C7W6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC172P0C7W6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC172P0C7W6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC172P0C7W6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC172P0C7W6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC172P0C7W6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC172P0C7W6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC172P0C7W6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC172P0C7W6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC172P0C7W6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC172P0C7W6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC172P0C7W6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC172P0C7W6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC172P0C7W6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC172P0C7W6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC172P0C7W6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms