Protein–RNA interactions for Protein: P08729

KRT7, Keratin, type II cytoskeletal 7, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT7P08729 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT7P08729 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT7P08729 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT7P08729 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT7P08729 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT7P08729 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT7P08729 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT7P08729 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT7P08729 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT7P08729 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT7P08729 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT7P08729 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT7P08729 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT7P08729 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT7P08729 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT7P08729 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT7P08729 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT7P08729 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT7P08729 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT7P08729 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT7P08729 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT7P08729 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT7P08729 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT7P08729 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT7P08729 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT7P08729 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT7P08729 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT7P08729 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT7P08729 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT7P08729 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT7P08729 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT7P08729 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT7P08729 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT7P08729 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT7P08729 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT7P08729 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT7P08729 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT7P08729 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT7P08729 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT7P08729 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT7P08729 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT7P08729 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT7P08729 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT7P08729 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT7P08729 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT7P08729 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT7P08729 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT7P08729 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT7P08729 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT7P08729 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT7P08729 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT7P08729 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT7P08729 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT7P08729 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT7P08729 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT7P08729 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT7P08729 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT7P08729 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT7P08729 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT7P08729 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT7P08729 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT7P08729 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT7P08729 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT7P08729 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT7P08729 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT7P08729 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT7P08729 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT7P08729 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT7P08729 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT7P08729 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT7P08729 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT7P08729 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT7P08729 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT7P08729 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT7P08729 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT7P08729 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT7P08729 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT7P08729 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT7P08729 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT7P08729 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
KRT7P08729 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
KRT7P08729 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT7P08729 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT7P08729 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT7P08729 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT7P08729 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT7P08729 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT7P08729 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT7P08729 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT7P08729 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT7P08729 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT7P08729 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT7P08729 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT7P08729 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT7P08729 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT7P08729 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT7P08729 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT7P08729 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT7P08729 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT7P08729 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms