Protein–RNA interactions for Protein: P08195

SLC3A2, 4F2 cell-surface antigen heavy chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A2P08195 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLC3A2P08195 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC3A2P08195 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC3A2P08195 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC3A2P08195 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC3A2P08195 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC3A2P08195 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC3A2P08195 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC3A2P08195 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC3A2P08195 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC3A2P08195 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC3A2P08195 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC3A2P08195 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC3A2P08195 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC3A2P08195 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC3A2P08195 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC3A2P08195 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC3A2P08195 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC3A2P08195 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC3A2P08195 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC3A2P08195 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC3A2P08195 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC3A2P08195 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC3A2P08195 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC3A2P08195 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC3A2P08195 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC3A2P08195 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC3A2P08195 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC3A2P08195 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC3A2P08195 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC3A2P08195 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC3A2P08195 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC3A2P08195 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC3A2P08195 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC3A2P08195 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC3A2P08195 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC3A2P08195 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC3A2P08195 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC3A2P08195 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC3A2P08195 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC3A2P08195 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC3A2P08195 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC3A2P08195 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC3A2P08195 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC3A2P08195 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC3A2P08195 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC3A2P08195 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC3A2P08195 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC3A2P08195 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC3A2P08195 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC3A2P08195 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC3A2P08195 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC3A2P08195 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC3A2P08195 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC3A2P08195 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC3A2P08195 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC3A2P08195 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC3A2P08195 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC3A2P08195 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC3A2P08195 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC3A2P08195 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC3A2P08195 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC3A2P08195 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC3A2P08195 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC3A2P08195 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC3A2P08195 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC3A2P08195 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC3A2P08195 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC3A2P08195 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC3A2P08195 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC3A2P08195 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC3A2P08195 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC3A2P08195 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC3A2P08195 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC3A2P08195 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC3A2P08195 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC3A2P08195 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC3A2P08195 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC3A2P08195 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC3A2P08195 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC3A2P08195 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC3A2P08195 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC3A2P08195 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC3A2P08195 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC3A2P08195 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC3A2P08195 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC3A2P08195 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC3A2P08195 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC3A2P08195 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC3A2P08195 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC3A2P08195 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC3A2P08195 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC3A2P08195 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC3A2P08195 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC3A2P08195 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC3A2P08195 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC3A2P08195 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC3A2P08195 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC3A2P08195 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC3A2P08195 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms