Protein–RNA interactions for Protein: P07359

GP1BA, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BAP07359 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GP1BAP07359 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GP1BAP07359 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GP1BAP07359 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GP1BAP07359 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GP1BAP07359 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GP1BAP07359 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GP1BAP07359 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GP1BAP07359 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GP1BAP07359 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GP1BAP07359 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GP1BAP07359 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GP1BAP07359 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GP1BAP07359 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GP1BAP07359 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GP1BAP07359 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GP1BAP07359 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GP1BAP07359 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GP1BAP07359 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GP1BAP07359 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GP1BAP07359 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GP1BAP07359 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GP1BAP07359 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GP1BAP07359 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GP1BAP07359 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GP1BAP07359 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GP1BAP07359 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GP1BAP07359 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GP1BAP07359 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GP1BAP07359 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GP1BAP07359 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GP1BAP07359 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GP1BAP07359 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GP1BAP07359 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GP1BAP07359 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GP1BAP07359 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GP1BAP07359 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GP1BAP07359 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GP1BAP07359 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GP1BAP07359 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GP1BAP07359 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GP1BAP07359 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GP1BAP07359 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GP1BAP07359 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GP1BAP07359 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GP1BAP07359 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GP1BAP07359 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GP1BAP07359 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GP1BAP07359 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GP1BAP07359 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GP1BAP07359 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GP1BAP07359 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GP1BAP07359 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GP1BAP07359 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GP1BAP07359 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GP1BAP07359 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GP1BAP07359 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GP1BAP07359 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GP1BAP07359 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GP1BAP07359 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GP1BAP07359 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GP1BAP07359 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GP1BAP07359 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GP1BAP07359 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GP1BAP07359 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GP1BAP07359 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GP1BAP07359 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GP1BAP07359 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GP1BAP07359 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GP1BAP07359 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GP1BAP07359 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GP1BAP07359 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GP1BAP07359 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GP1BAP07359 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GP1BAP07359 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GP1BAP07359 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GP1BAP07359 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GP1BAP07359 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GP1BAP07359 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GP1BAP07359 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GP1BAP07359 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GP1BAP07359 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GP1BAP07359 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GP1BAP07359 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GP1BAP07359 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GP1BAP07359 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GP1BAP07359 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GP1BAP07359 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GP1BAP07359 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GP1BAP07359 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GP1BAP07359 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GP1BAP07359 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GP1BAP07359 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GP1BAP07359 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GP1BAP07359 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GP1BAP07359 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GP1BAP07359 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GP1BAP07359 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GP1BAP07359 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GP1BAP07359 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms