Protein–RNA interactions for Protein: P04436

T-cell receptor alpha chain V region HPB-MLT (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04436 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
P04436 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P04436 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P04436 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P04436 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
P04436 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P04436 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
P04436 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
P04436 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P04436 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
P04436 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
P04436 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
P04436 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
P04436 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
P04436 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
P04436 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
P04436 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
P04436 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P04436 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
P04436 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
P04436 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
P04436 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P04436 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P04436 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P04436 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
P04436 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
P04436 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P04436 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
P04436 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
P04436 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
P04436 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
P04436 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
P04436 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
P04436 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P04436 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
P04436 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
P04436 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P04436 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P04436 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
P04436 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P04436 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
P04436 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
P04436 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
P04436 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
P04436 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
P04436 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
P04436 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
P04436 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
P04436 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
P04436 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
P04436 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
P04436 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
P04436 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P04436 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P04436 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P04436 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
P04436 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
P04436 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
P04436 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
P04436 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
P04436 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
P04436 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
P04436 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P04436 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P04436 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
P04436 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P04436 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
P04436 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
P04436 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
P04436 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P04436 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P04436 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P04436 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P04436 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
P04436 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
P04436 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P04436 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
P04436 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
P04436 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P04436 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P04436 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
P04436 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P04436 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
P04436 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P04436 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
P04436 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
P04436 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
P04436 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
P04436 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
P04436 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
P04436 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
P04436 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P04436 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
P04436 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P04436 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P04436 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
P04436 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P04436 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
P04436 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
P04436 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms