Protein–RNA interactions for Protein: P04156

PRNP, Major prion protein, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRNPP04156 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRNPP04156 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRNPP04156 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRNPP04156 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRNPP04156 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRNPP04156 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRNPP04156 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
PRNPP04156 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRNPP04156 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRNPP04156 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRNPP04156 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRNPP04156 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRNPP04156 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRNPP04156 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRNPP04156 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRNPP04156 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRNPP04156 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRNPP04156 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRNPP04156 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRNPP04156 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRNPP04156 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRNPP04156 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRNPP04156 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRNPP04156 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRNPP04156 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRNPP04156 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRNPP04156 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRNPP04156 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRNPP04156 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRNPP04156 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PRNPP04156 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PRNPP04156 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRNPP04156 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRNPP04156 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRNPP04156 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRNPP04156 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PRNPP04156 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRNPP04156 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PRNPP04156 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRNPP04156 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRNPP04156 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRNPP04156 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRNPP04156 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRNPP04156 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRNPP04156 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRNPP04156 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRNPP04156 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRNPP04156 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRNPP04156 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRNPP04156 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRNPP04156 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRNPP04156 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRNPP04156 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRNPP04156 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRNPP04156 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PRNPP04156 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRNPP04156 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRNPP04156 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRNPP04156 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRNPP04156 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRNPP04156 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRNPP04156 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PRNPP04156 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRNPP04156 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PRNPP04156 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRNPP04156 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRNPP04156 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRNPP04156 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRNPP04156 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PRNPP04156 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PRNPP04156 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PRNPP04156 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRNPP04156 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRNPP04156 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRNPP04156 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PRNPP04156 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PRNPP04156 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRNPP04156 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRNPP04156 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRNPP04156 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRNPP04156 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRNPP04156 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRNPP04156 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRNPP04156 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRNPP04156 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRNPP04156 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRNPP04156 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRNPP04156 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRNPP04156 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRNPP04156 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRNPP04156 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRNPP04156 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRNPP04156 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRNPP04156 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRNPP04156 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRNPP04156 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRNPP04156 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRNPP04156 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRNPP04156 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRNPP04156 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms